一、紫斑病。主要危害细香葱、大葱、大蒜、洋葱、韭菜等，是大葱、大蒜的主要病害，叶和花梗为主要受害部位。病斑初为水渍状，灰白色，稍凹陷，后扩大成椭圆形或梭形，呈紫褐色。湿度大时，病部产生呈同心轮纹状排列的黑色霉层。发病重时引起叶、梗枯死或折倒。温暖多湿的条件或缺肥干旱时病害发生重。砂质土、旱地及蓟马危害重的田块发病严重。
⑴农业防治：施足底肥，增施磷钾肥，加强田间管理，实行与非葱类作物轮作。⑵种子处理：播种前用40%福尔马林300倍液浸种3小时，水洗晾干后播种。鳞茎可用40-45℃温水浸1.5小时。⑶药剂防治：发病初期喷施70%代森锰锌可湿粉600倍液，或75%百菌清+70%托布津可湿粉(1：1)1000-1500 倍液，或64%杀毒矾500倍液，或50%施保功乳油1200倍液，隔7-10天喷1次，共喷2-3次。注意交替使用和混用。
二、病毒病。葱蒜类病毒病以大蒜和薤为多见。大蒜和薤发病后，出现黄绿相间的长条斑，病株矮缩，叶片雏缩扭曲，鳞茎变小、僵硬，分蘖减少，影响产量和品质。病毒病主要由蚜虫传播。一般高温干旱、管理粗放、蚜虫发生量大，或植株偏施氮肥、缺肥、植株生长不良等均发病重。
⑴农业防治：清洁田园，减少毒源。适时播种，加强肥水管理，重施有机肥，多用复合肥或磷钾肥，忌偏施氮肥。及时拔除、烧毁病株。⑵物理防治：采用银灰色薄膜避蚜；在苗床上方每隔60-100厘米挂1块3-6厘米宽的银灰色薄膜，有避蚜防毒之效。设黄板诱蚜。黄板上涂机油插于田间(高约60厘米)，可诱杀有翅蚜。⑶药剂防治：发病初期喷1.5%植后灵乳剂1000倍液加20%病毒A可湿粉500倍液，或1.5%植病灵乳剂1000倍液，或20%病毒A可湿粉500倍液，或83增抗剂100倍液，或抗毒剂1号300倍液，7-10天1次。共喷2-3次。
三、细菌性软腐病。葱蒜类细菌性软腐病以大蒜、大葱、洋葱为多见。大蒜染病后，一般先从脚叶的叶缘或中脉发病，形成黄白色条斑，可贯穿整个叶片，温度大时，病部呈黄褐色软腐状，后逐渐向上部叶片扩展，致全株枯黄。
⑴农业防治：合理轮作。加强肥水管理，施足基肥，实行配方施肥；低洼地宜高畦种植，及时排除积水；注意田间卫生。⑵药剂防治：发病初期及时喷药，喷、淋相结合。可使用23%络氨铜水剂250-300倍液灌根；或喷72%农用链霉素4000倍液，或新植霉素4000倍液，或77%氢氧化铜(可杀得可湿粉)4 00-500 倍液交替使用，连喷3-4次。
