杀菌剂一般分为保护性杀菌剂和治疗性杀菌剂，要注意二者的区别使用。
保护性杀菌剂是预防效果好而治疗效果差。如链霉素、代森锰锌、大生、阿米西达、达克宁等，喷施后，在作物体表形成一层保护膜，阻碍病原孢子进入植物体，并能抑制植物体内的孢子囊萌发孢子。对刚萌发的孢子也有杀灭作用。正因为保护剂所具有的这些特性，其正确施用方法应是在作物发病前施用，其防护效果显著。此时若直接用治疗剂，不仅防治效果差，还容易发生药害。
而治疗性杀菌剂是预防效果差而治疗效果好。如金雷、普力克、乙磷铝锰锌、世高、银法利等，在感病孢子已经侵入作物体内，作物上已经出现了明显的病症，部分叶片、茎秆或果实已出现病斑等症状时，需要选用治疗性杀菌剂，可以杀死已经萌发的孢子和孢子囊，达到理想的治疗效果。如果此时再用保护剂防治为时已晚，往往是白白浪费了人力和物力。生产中不少菜农将保护性和治疗性杀菌剂混用一气，结果导致用药效果不好。以后再用药，菜农可要分清剂型，正确应用了。
