一、治疗孕畜疾病时，首先考虑药物对胚胎和胎儿有无直接或间接的严重危害作用。其次要考虑药物对母体有无副作用与毒害作用。
二、母畜怀孕早期用药要慎重，应选用不会引起胚胎死亡和致畸的常用药物。
三、孕畜用药剂量不宜过大，时间不宜过长，以免药物蓄积作用而危害胚胎或胎儿。
四、孕畜应慎用全身麻醉药、止泻药、驱虫剂和利尿剂，禁用有直接或间接影响生殖机能的药物，如前列腺素、肾上腺素和促肾上腺皮质激素、雌激素。严禁使用使子宫收缩的药物，如催产素、垂体后叶制剂、麦角制剂、氨甲酰胆碱和毛果芸香碱。使用中药时应禁用活血祛淤、行气破滞、辛热、滑利中药如桃仁、红花、乌头等。云南白药、地塞米松也应慎重使用。
五、孕畜发生疾病时，须考虑药物对胚胎和胎儿有无潜在性危害作用，但要改变那种认为“孕畜用药都是有害的”的观点。为了确保胚胎和胎儿的安全而延误治疗，反而会损害母畜的健康，造成母畜与胎儿双亡的现象。因此，孕畜患病时应积极用药治疗，确保母体健康，力求所用药物对胚胎和胎儿无严重危害作用。
