一、有机农业是不使用化学合成物质的农业吗？
不使用化学合成物质(化学农药，肥料生长调节剂等)是实施有机农业的基本手段和条件，但不是有机农业生产的根本目的。简单地把有机农业理解为不使用农用化学物质，而不采取任何管理措施的生产系统不能视为有机生产系统。有机农业强调环境与生态的和谐，保护土壤，防止水土流失，实现可持续生产体系的发展。因此，在我们的认证中有一部分很重要的内容，就是要求有机食品的生产者和申请人必须建立比较完整的质量管理体系，包括建立规范的质量管理手册、科学完整的生产操作规程、生产过程的详细记录和严格的追踪程序。
二、有机食品是绝对无污染的食品吗？
食品是否有污染是一个相对的概念。世界上不存在绝对不含有任何污染物质的食品。随着分析技术的发展和分析仪器的精密度的提高，所谓的“不得检出”的说法是不科学的。由于有机食品的生产过程不使用化学合成物质，因此，有机食品中污染物质的含量一般要比普通食品低，但是过分强调其无污染的特性，会导致人们只重视对终端产品污染状况的分析与检测，而忽视有机食品生产全过程质量控制的宗旨。
三、有机农业是传统农业的回归吗？
由于石油农业带来的能源，环境和食品安全的问题日益严重，而有机农业通过不使用化学合成的农家肥料等方法不仅可以合理利用自然资源，有效地提高农业生产，而且可以保护生态环境，促进人与自然的协调发展。但是有机农业并不排斥现代的科学技术，有机农业充分利用现代生物学土壤学和生态学的知识，应用现代的农业机械、作物选种、生物防治和水土保持技术，并在生产过程中建立严格的质量管理体系。因此，有机农业并不是传统农业的回归，其概念的提出也得到了广泛的重视与回应。
四、有机农业的产量比常规农业的产量低吗？
从常规种植向有机种植转换是增产还是减产?在许多情况下，在开始转换之初会出现减产，特别是原来严重依赖化肥与农药的地区。但是，在那些原来对农药、化肥使用较少的地区，有机种植就可能不会减产，相反，还可能增产。这种有机种植生产能力的增加有几方面的原因:
1.通过轮作、间作和各样种植，农业生产系统的多样性得到改善;
2.种植或间作绿肥作物;
3.通过利用作物秸杆还田(或制作堆肥以后还田)，促进了农田养分循环;
4.较好地利用了周围生态系统的有机物质，利用了自然资源，尤其是水资源;
5.将养殖业和种植业结合起来，改善了养分的管理水平;
6.更加注意了水土保持。
另外产量高低也是一个相对的概念，通过超过系统可承受的外部物质的投入来获得过高的产量并不是有机农业追求的目标，有机农业追求的是可持续的产量与质量。
一、有机农业投入多，成本高，效益低吗？
有机农业生产强调优先使用当地资源，优化在同一土地上多种植物和动物对资源的利用。这种时间与空间上生物多样性的管理，是农民对农业系统生产的多次投入。例如循环利用农业废弃物和人工除草的劳动力投入。但是有机农业生产充分利用了农业系统内部的废弃物，减少了社会用于治理环境污染所花的费用，同时增加了土壤中较高的生物量和微生物种群密度，提高了土壤的活力，保持和促进减农田周围的生物多样性，减轻了环境污染对人体健康和社会造成的直接和间接的经济损失。
通过有机食品的优化管理，不支出或减少支出购买化肥，农药的成本和在市场卖得较高的价格，从长远来看，一旦建立良性的有机农业生产体系，其综合的生产力一般高于常规体系的生产力，其最终效益高于常规的生产。
二、有机农业就是用有机化肥代替化肥吗？
目前，在有机农业生产中，为了代替化肥，需要使用大量的有机肥。有机肥在发展有机食品中占有极其重要的地位，它在培肥地力与改善作物品质，特别是改善食品风味等品质方面的作用以得到充分肯定。但近年因饲料添加剂的应用，使工厂化养殖场畜禽排泄物中含有较高的重金属，如铜，砷等。同时，有机肥中还可能含有病源微生物和寄生虫卵。因此，在我们的认证中，对有机肥的使用限定了许多条件，不仅要求有一定的施肥数量，而且对有机肥的来源，有机肥的质量都有具体要求。过量使用、使用时间不恰当或使用不符合的标准的有机肥，都要影响作物的生长和品质并导致环境的严重污染。
三、有机食品是处在“塔尖”的食品吗?
目前比较流行的一种说法，我国推广的三种安全农产品:无公害食品，绿色食品，有机食品。有机食品是最高层次的“塔尖”安全食品。这种观点是片面的。
现阶段，我国农产品质量安全工作的全面推进“无公害食品行动计划”为切入点，加快无公害产品，绿色食品和有机食品的发展，并根据各类产品的不同特点和发展目标，采取了不同的发展机制。无公害农产品保障大众消费者最基本的食品安全的要求。是最基本的市场准入条件。绿色食品质量安全标准达到发达国家的先进水平。满足消费者食品质量安全更高层次的需求;有机食品采取市场化的运作方式，根据我国国情，同时借鉴国际的通行做法。从食品安全的角度，更确切地说，从量化的指标衡量，它们都属于安全农产品的范畴。应该说，有机食品从生产方式的难易程度，消费者层次和价格上确实处在较高的“塔尖”，但目前还没有充分的证据说明三者之间在安全水平上存在明显的差异。我们应该借鉴国际经验，结合我国国情，探讨和健全完善无公害农产品，绿色食品和有机食品的独具特色的发展模式，推动农产品质量安全水平的全面提高。
