1.认证依据
认证依据的标准或技术规范是一种认证制度区别于其他认证制度的主要特征，各种食品农产品认证制度间的根本区别也体现在标准的不同，建立一种认证制度的必要性也与标准有关。比如经常有消费者甚至是认证监管人员对无公害农产品认证、绿色食品认证和有机产品认证的区别感到迷惑，其实分别把三种认证制度依据的标准对比一下，就非常清楚了。无公害农产品认证依据的是无公害农产品国家标准或行业标准，对于农药和化肥的使用仅规定不使用国家禁止使用的农药和化肥，对于农药化肥残留量也是国家强制标准规定；绿色食品认证依据的是农业部绿色食品行业标准，其农药和化肥的使用要减少，残留量的限量也加严了；有机产品认证依据的是有机产品国家标准，不允许使用农药和化肥，农药残留限量不能超过国家强制标准的5%。
2.认证基本规范
认证基本规范是指认证活动必须依据的，包括认证制度设立、认证性质、认证模式及选择方式、技术要求和基本实施程序和对实施机构和人员要求，表示合格的方式等的文件。认证规则是指对某（类）产品、服务或管理体系实施认证的基本规则和程序。认证基本规范和认证规则都应由国务院认证认可主管部门制订和发布，往往以部门规章、规范性文件形式发布。以有机产品认证为例，其认证基本规范就是《有机产品认证管理办法》以国家质检总局令形式发布，《有机产
品认证实施规则》以国家认监委公告形式发布。随着我国认证认可制度的完善，在设立新的认证制度时，往往不需要单独制订认证基本规范，而将相关特定要求融合到认证规则中。
基本规范中规定的认证性质和认证模式，对实施机构和人员的要求及表示合格的方式也是区分各种认证制度的重要特征。这里以比较常见的有机产品认证、无公害农产品认证和HACCP 认证为例来进行分析。认证性质和认证模式指这种认证是产品认证还是体系认证，有机产品认证和无公害农产品认证都是产品认证，而HACCP 认证是体系认证；对实施机构和人员的要求一般指机构的准入（批准）条件，是否要求认可，检查（审核）人员是否需要注册等，以上三种认证制度在
其认证基本规范中都明确要求要获得认可，有机产品认证检查员和HACCP 认证审核员都需要在中国认证认可协会进行注册，而无公害农产品认证无此要求；表示合格的方式除了认证证书外还包括认证标志及施用方式，有机产品认证和无公害农产品认证作为产品认证允许在获证产品上使用相应产品认证标志，而HACCP认证作为一种体系认证，不能在产品上使用产品认证标志，也不能误导公众认为其产品已通过认证。
3.合格评定程序
合格评定程序即认证机构开展相应认证活动的程序要求。相同认证性质和认证模式的的认证制度开展认证的程序基本一致。
各类食品农产品认证依据标准、基本规范/规则一览
| 序号 | 认证制度 | 认证基本规范 | 认证依据标准 |
| 1 | 良好农业规范认证 | 《良好农业规范认证实施规则》（CNCA-N-004:2007） | 良好农业规范系列国家标准（GB/T20014.1～24） |
| 2 | 有机产品认证 | 《有机产品认证管理办法》（国家质检总局令［2004］第67 号） | 《有机产品认证实施规则》（国家认监委公告［2005］年第11 号）《有机产品》国家标准（GB/T19630） |
| 3 | 食品安全管理 体系认证 | 《食品安全管理体系认证实施规则》 | (国家认监委2010 年第5 号公告)GB/T22000-2006《食品安全管理体系 食品链中各类组织的要求》 |
| 4 | 食品质量认证 | 《食品质量认证实施规则—酒类》 | 酒类产品国家标准 |
| 5 | HACCP 认证 | 《食品生产企业危害分析与关键控制点（HACCP）管理体系认证管理规定》(认监委公告2002 年第3 号)《乳制品生产企业危害分析与关键控制点体系认证实施规则（试行）》 | GB/T 27341《危害分析与关键控制点体系 食品生产企 业通用要求》、GB/T 27342 《危害分析与关键控制点体 系 乳制品生产企业要求》 《食品卫生通则》 CAC/RCP1-1969，Rev.4 （2003）及其附件《HACCP 体系及其应用准则》 SN/T1443.1—2004 食品安全 管理体系要求 |
| 6 | 绿色市场认证 | 《绿色市场认证管理办法》 （2003 年第14 号公告） 《绿色市场认证实施规则》 （2004 年第13 号公告） | GB/T19220 农副产品绿色批发市场 GB/T19221 农副产品绿色零售市场 |
| 7 | 无公害农产品 认证 | 《无公害农产品管理办法》 （农业部、质检总局第12 号令） 《无公害农产品产地认定程序》 《无公害农产品产地认定程序》 《无公害农产品标志管理办法》 （农业部、认监委2002 年第231 号 公告） | 相关无公害国家标准和无公 害行业标准 |
| 8 | 绿色食品认证 | 《绿色食品标志管理办法》 （国家认监委尚未发布相关认证基 本规范和认证规则） | 绿色食品行业标准 |
| 9 | 饲料产品认证 | 《饲料产品认证管理办法》 （2003 年第19 号公告） 《饲料产品认证实施规则》 （2004 年第11 号公告） | 饲料产品国家标准 |
| 10 | 乳制品GMP 认 证 | 《乳制品生产企业良好生产规范认 证实施规则（试行）》 | 乳制品企业良好生产规范 (GB12693) |
