1. 实验进行前，无菌室及无菌操作台以紫外灯照射 30-60 分钟灭菌，以 75% 乙醇擦拭无菌操作台面，并开启无菌操作台风扇运转 10 分钟后，再开始实验操作。每次操作只处理一株细胞株，且即使培养基相同也不共享培养基，以避免失误混淆或细胞间污染。实验完毕后，将实验物品带出工作台，以 75% 乙醇擦拭无菌操作台面。操作间隔应让无菌操作台运转 10 分钟以上后，再进行下一个细胞株之操作。
2. 无菌操作工作区域应保持清洁及宽敞。必要物品，例如试管架、吸管吸取器或吸管盒等可以暂时放置，其它实验用品用完即应移出，以利于气流流通。实验用品用75% 乙醇擦拭后才带入无菌操作台内。实验操作应在台面之内无菌区域，勿在边缘非无菌区域操作。
3. 小心取用无菌实验物品，避免造成污染。勿碰触吸管尖头部或是容器瓶口，亦不要在打开容器正上方操作实验。容器打开后，以手夹住瓶盖并握住瓶身，倾斜约 45°取用，尽量勿将瓶盖盖口朝上放置桌面。
4. 工作人员应注意自身安全，须穿戴实验衣及手套后才进行实验。对于来自人类或是病毒感染细胞株应特别小心操作，并选择适当等级的无菌操作台（至少Class II）。操作过程中，小心毒性药品，例如 DMSO 及 TPA 等，并避免尖锐针头伤害等。
5. 定期检测下列项目：
5.1. CO2 钢瓶中 CO2 压力。
5.2. CO2 培养箱：CO2 浓度、温度、及水盘是否有污染（水盘的水用无菌水，每周更换）。
5.3. 定期更换紫外线灯管及HEPA 过滤膜，预滤网（300小时/预滤网，3000 小时/HEPA）。
6. 水槽可添加消毒剂（新洁尔灭 1:750），定期更换水槽的水。
