发酵是生物实验重要的工具。它是微生物自身生产或直接利用微生物进行有氧厌氧生物活性代谢的过程。生物发酵罐广泛应用于乳制品、饮料生物工程、制药、精细化工等行业，乳制品和酒类进行发酵处理。
发酵罐的应用涉及到其细菌的复杂控制，控制其他细菌在发酵过程的影响。如果发酵过程污染细菌，会严重影响发酵过程，导致发酵过程的产量下降，更严重的可能会导致整个发酵过程的失败，发酵产品不能满足的需求，整个发酵过程的失败。因此我们要注意采取灭菌操作。由于工业操作的特点，发酵罐灭菌传统普遍采用湿热灭菌法。
然而，发酵罐采用湿热灭菌法，也存在一些弊端，因为影响湿热灭菌的主要因素有：微生物的种类与数量、蒸汽的性质、产品性质和灭菌时间等。例如采用流通蒸气灭菌法：是指在常压条件下，采用100摄氏度流通蒸气加热杀灭微生物的方法，灭菌时间通常为30-60分钟。该法适用于消毒以及不耐高热制剂的灭菌，但不能保证杀灭所有芽孢，是非可靠的灭菌方法。
所以说，发酵罐灭菌，对芽孢的杀灭是一个难点。芽孢本身的特质是：的含水率接近40% ，较低的水分是其能够抵御外界不良因素的主要原因，其次具有多糖类构成的致密孢子壁，是抵御不良物质的屏障，在萌发后会变成细胞壁芽孢在化学成分上也与其营养细胞有差异，尤其是芽孢中含有营养细胞所没有的DPA-Ca(吡啶二羧酸钙)，该物质会使芽孢中的生命大分子物质形成稳定而耐热性强的凝胶，其耐热性随着DPA-Ca的消失而消失，被认为是芽孢耐热的主要根源。
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