在食品加工中直接着色不多，主要用于与天然的黄色素如栀子黄色素、红花黄色素等配伍，调配出不同色泽的绿色素，与提取的叶绿素相比，用栀子蓝色素调配的绿色素色调可以控制、耐酸性好，可用于偏酸性的食品、饮料中。另外栀子蓝色素还可与各种天然的红色素配伍，调配出不同色调的紫色。因此栀子蓝色素在食品加工中有较广阔的应用范围。
栀子蓝色素因加工工艺的不同，可获得不同色调的蓝色素，颜色从天蓝色到海蓝色，还有耐酸性和不耐酸的品种，适合于不同的应用环境。
天然的蓝色素自然界中是很少有的，栀子蓝色素是其中的一种，与色素食用亮蓝、靛蓝相比，其来源天然、人体相容性好，安全性高。是一种值得大力推广的天然色素
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