该化合物被认为是碳水化合物-蛋白质交互作用的放大器。基于对碳水化合物基底的免疫反应，拟糖蛋白可用于抗体生产，也应用于更多的分析方法，包括组织化学、酶联免疫检测、印迹分析、亲和层析……它们也是极其有用的生物标记和靶点药物。相对游离糖，拟糖蛋白有更高的亲和力（100~10000倍），亦引人关注。可根据需求使用牛血清白蛋白以外的蛋白质。
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