赛默飞Orbitrap Eclipse三合一超高分辨质谱仪从根本上提高了定量蛋白质组分析的灵敏度、速度和准确性,以及全面定义蛋白质形式和蛋白质复合物的能力。HMRn(高质量范围MSn)、PTCR(质子转移电荷减少)和RTS(实时搜索)的加入是专门设计的功能,极大地提高了质谱识别重要生物分子的能力,并在结构上以的详细程度对它们进行研究。在保持Orbitrap Fusion Lumos三合一质谱性能的基础上,Eclipse提升了如下主要性能:(1)HMRn(High Mass Range MSn,高质量范围MSn):MSn多级质谱的分子量范围可达到8,000 Da,包括扩展Orbitrap的m/z 至8,000和LTQ分离母离子m/z至8,000,并具有MSn(n=1~10)能力。比如使用HMRn做NativeOmics,可以用多级质谱鉴定膜蛋白的配体,更好理解蛋白的相互作用。(2)PTCR(Proton Transfer Charge Reduction ,质子转移电荷减少)离子源:全氟菲烷(PFPP) 离子,用于随后双级线性离子阱中的气相离子反应,利用质子转移减少母离子或子离子的多电荷态,使多电荷谱图的质量提高、Top-down组学的解析更容易,可以更好地揭示蛋白隐藏的特征。(3)RTS(Real-time search实时搜索)算法软件:提供了强大的数据库功能,当已鉴定的蛋白和初始数据库匹配一致就标记为不再进行MS3,因此可有效缩短时间,提升1倍通量。在选择已确定的母离子进行 SPS MS3 定量时,可提高定量准确性和TMT实验的蛋白质组覆盖率。(4)双曲面QR5 分段四极杆:增长为25 cm,并扩大直径,提升离子传输效率,并可有限选择分离0.4 Da的母离子。(5)具有50万分辨率,扩展选项后可达到100万分辨率。
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