一、脉冲场凝胶电泳分型(pulse field gel electrophoresis,PFGE)
PFGE选用识别稀有酶切位点的限制性内切酶切割基因组DNA,获得的DNA片段在外加脉冲电场的低浓度琼脂糖凝胶中分离,产生数量有限的DNA条带。PFGE分型力好、分辨力高、可重复性好、已有成熟的标准化技术方案、已实现数据分析的网络化,对于大部分细菌是暴发溯源中细菌分型的“金标准”。
二、多位点可变数目串联重复序列分型(Multilocus VNTR analysis, MLVA)
MLVA是以PCR为基础,根据被检菌株散在于基因组中不同位点的、VNTR的重复单元拷贝数的差异来进行分子分型的技术。VNTR: Variable Number Tandem Repeat ,数目可变的串联重复序列,又称卫星DNA (Satellite DNA)。
三、多位点序列分型(Multilocus sequence typing,MLST)
MLST是基于细菌核苷酸序列比对的一种分子分型方法,其原理是通过比较细菌个体7个或者更多管家基因的核苷酸序列的多态性,确定其基因多态性,同时通过划分序列群和构建小生成树来揭示细菌群体遗传结构。
四、其他细菌检测服务
耐药基因、毒力基因、特殊表型检测等。
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