微波杀菌设备是利用了电磁场的热效应和生物效应的共同作用的结果。微波对细菌的热效应是使细菌环境变化，使细菌失去营养，繁殖和生存的条件而死亡。微波对细菌的生物效应是是微波电场改变细胞膜断面的电位分布，影响细胞膜周围电子和离子浓度，从而改变细胞膜的通透性能，细菌因此营养不良，不能正常新陈代谢人。
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