近日，中国水产科学研究院北戴河中心实验站牙鲆遗传育种创新团队在牙鲆无眼侧黑化性状研究方面取得新进展，相关研究成果以“Identification candidate genes and loci associated with hypermelanosis of the blind side in Japanese flounder （Paralichthys olivaceus） using the combination of RNA-Seq and BSA-Seq”为题发表于《Aquaculture》（JCR 1区期刊，IF：3.9，全文网址为：https://doi.org/10.1016/j.aquaculture.2024.741583）。团队刘名扬研究实习员、伞利择研究实习员为第一作者，侯吉伦研究员、王桂兴副研究员为通讯作者。
在牙鲆工厂化养殖过程中，无眼侧皮肤黑化严重影响其经济价值。雌核发育作为一种可有效提升遗传同质性并固定特定性状的技术，被广泛地应用于鱼类遗传育种研究中。在本研究中，团队利用雌核发育技术制备了正常和无眼侧皮肤黑化牙鲆的重组双倍体群体，构建了皮肤转录组文库和BSA-seq的分离池（Po_N和Po_H）。通过RNA-seq和BSA-seq相结合，筛选到5个InDel和3个SNP，经204尾个体基因型验证和qRT-PCR实验证明候选基因ca4a和mreg中的3个位点与该性状显著相关。研究结果为解析牙鲆无眼侧黑化的分子机制以及全白底板牙鲆的选育提供了重要的支撑。
本研究得到中国水产科学研究院基本科研业务费（2023TD41）、河北省重点研发计划（21326307D）、河北省自然科学基金（C2023107012）、国家海水鱼产业技术体系（CARS-47）和国家海洋水产种质资源库等项目的资助。
日期：2024-09-25
