日前,由淡水渔业研究中心傅洪拓研究员领衔的水科院淡水虾蟹遗传育种创新团队在青虾低氧应激研究领域取得重要进展,相关成果论文“Integrated metabolomics and Transcriptomic Analysis of Hepatopancreas in Different Living StatusMacrobrachium nipponensein Response to Hypoxia”发表于期刊《Antioxidants》(JCR二区TOP,IF=7.675)上。
青虾耐低氧能力极差,在养殖以及运输过程中极易因缺氧而导致死亡,因此,对青虾耐低氧分子机制开展的研究对青虾产业发展壮大的重要性不言而喻。针对上述问题,团队以日本沼虾为研究对象,结合缺氧时不同生理状态(存活、濒死和死亡)下日本沼虾的肝胰腺代谢组和转录组进行比较分析,分别发现了108、86和48种差异表达代谢物(differentially expressed metabolites,DEM)。通过分析发现了32种共有DEM,通过对共有DEM的筛选和低氧应激相关基因联合分析,鉴定出12个低氧应激相关基因。其中,GTP磷酸烯醇丙酮酸酯羧激酶(PEPCK)是唯一在转录组和代谢组中排名均靠前的差异表达基因,因此,它被认为在调控青虾缺氧应答过程中发挥重要作用。该研究填补了缺氧转录组分析片面性的缺口,并从代谢物中反向推断出几个与缺氧相关的新基因。本研究有助于说明缺氧胁迫下日本沼虾相关的分子过程。
该项研究得到了蓝色粮仓重点研发计划(2018YFD0901303)和水科院基本科研业务费项目(2020TD36)等项目的支持。淡水中心水产遗传育种研究室博士研究生许蕾为第一作者、傅洪拓研究员为通讯作者。
全文网址:https://www.mdpi.com/journal/antioxidants。
日期:2023-04-05