2月16日，中国机构编制网发布了《中共中央办公厅 国务院办公厅关于调整国家卫生健康委员会职能配置、内设机构和人员编制的通知》（简称“《通知》”），对国家卫生健康委员会职能配置、内设机构和人员编制做出调整。
《通知》在职责调整中提到，国家卫生健康委员会负责管理国家疾病预防控制局，将下述职责划入国家疾病预防控制局：制定并组织落实传染病预防控制规划、国家免疫规划以及严重危害人民健康公共卫生问题的干预措施，制定检疫、监测传染病目录；组织指导传染病疫情预防控制，编制专项预案并组织实施，指导监督预案演练，发布传染病疫情信息，指导开展寄生虫病与地方病防控工作；负责职责范围内的职业卫生、放射卫生、环境卫生、学校卫生、公共场所卫生、饮用水卫生等公共卫生的监督管理，负责传染病防治监督，健全卫生健康综合监督体系；制定传染病医疗机构管理办法并监督实施。另外，国家卫生健康委员会还负责卫生应急工作，牵头组织协调传染病疫情应对工作，组织指导传染病以外的其他突发公共卫生事件预防控制和各类突发公共事件医疗卫生救援，与海关总署建立健全应对口岸公共卫生事件合作机制和通报交流机制。
同时，对内设机构做出重大调整：国家卫生健康委员会医政医管局更名为医政司；国家卫生健康委员会卫生应急办公室（突发公共卫生事件应急指挥中心）更名为医疗应急司；撤销国家卫生健康委员会疾病预防控制局、综合监督局；调整国家卫生健康委员会机关党委（党组巡视工作领导小组办公室）职责。
在编制职数上，经调整后，国家卫生健康委员会设19个内设机构及机关党委（党组巡视工作领导小组办公室）、离退休干部局。机关行政编制464名。设主任1名，副主任4名，司局级领导职数80名（含机关党委专职副书记1名、机关纪委领导职数1名、卫生健康监察专员10名、离退休干部局领导职数2名）。
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