金针菇经用铝塑复合袋包装之后，不仅能有效延长保质期，方便运输，携带，而且能改善商品外观，提高商品附加值。
包装前，要剪去新鲜金针菇柄基部褐色段，并剔除畸形、带病虫斑点和大小不均的菇体，再按下述标准分级。一级：柄长大于12厘米，盖径1.5厘米，色略黄白；二级：柄长10～12厘米，盖径1.0～1.5厘米，色较深黄；等外品：10厘米以下细柄、小菇，或基根粗老、色深。选分后便可进行包装操作，同时注意避免与铁、铜质的器皿接触，以防影响色泽。
漂洗：新鲜菇放入0.05%焦亚硫酸钠溶液或0.5%食盐溶液中清洗两次，再用流动水冲洗1～2遍，尽量减轻污垢残留。
软化、护色：净水中添加0.5%的柠檬酸，预热至90℃左右后，放进金针菇浸泡3～5分钟。此举既可使金针菇组织软化，便于包装，又能破坏其酶活性，稳定菇色。捞起后取清水洗去菇体表面的分泌物，沥干。
装袋，灌汤汁：将一束50～100克烫漂过的金针菇装入复合袋内，然后灌入占总量5%～10%的汤汁。汤汁的配法是：水10公斤、精盐250克煮沸，接着拌入柠檬酸50克、味精10克、山梨酸钠防腐剂5克，用纱布过滤。
密封、杀菌：复合袋灌入汤汁后，立即进热封机封口。袋口密封宽度一般不得低于0.6厘米。杀菌时，蒸汽温度控制在110～115℃，时间10～15分钟。杀菌完毕，迅速放冷水下淋降温至40～50℃，揩干，搁置5～7天后检验，剔除膨胀袋，合格袋贴商标入库。
