进入秋季应以水质调节为主，先用水质净化剂以较快的速度降低水体的氨氮与亚硝酸氮，两天后补充调水生物制剂（如光合菌、硝化细菌等），壮大水体的有益微生物种群，使养殖水体变好并保持较长时间的稳定。
水质调节好，甲鱼的摄食量提高，是甲鱼快速生长的必备条件。饲料质量是确保甲鱼快速生长的关键，特别在甲鱼需求的蛋白质与脂肪方面。养殖户如果有条件，在饲料中加入20%以下的鲜鱼或优质冰鲜鱼鱼浆投喂，可大大提高甲鱼生长速度与肥满度。另外，由于9月甲鱼食量增加，投喂时添加预防肠炎药物，如穿心莲、大蒜等，连用几天。
