近年来，有些养殖场（户）采取畜禽混合养殖，用某种畜禽的粪便饲喂另一种畜禽。但必须注意，这样的食物链存在很大的危险。因为畜禽粪便的成分比较复杂，含有多种对畜禽健康不利的成分，极易造成畜禽交叉感染或传染病的暴发。因此，饲喂畜禽粪便前必须做好如下处理：
作饲料的畜禽粪便必须经过发酵处理，严禁直接饲喂；用发酵过的畜禽粪便饲喂畜禽时，要添加一些抗菌素，如土霉素等；用发酵粪便饲喂畜禽时，应由少到多，逐渐添加，而且用量不超过日粮的４０％；由于发酵粪便的适口性差，饲喂时可添加一些调味剂，如食盐、糖精等；要经常喂给畜禽青绿饲料；要定期驱虫，鸡每月一次，猪半月一次；出栏前半个月必须停止饲喂畜禽粪便。
