目前，水产品无论在品种上还是数量上都非常丰富，但是人们普遍发现水产品的口感不如以前，尤其是鱼虾的药物残留严重地危害着人体健康。人工养殖的水产品，因过多地使用药物和增大养殖密度，不仅影响了养殖用水的水质，也降低了水产品的品质。生物净化法就是通过生物净化水质的方法来调节养殖用水，为水产品的生长提供良好的生长环境，具体的方法有以下几种：
一、养护单胞藻
通过合理施肥繁殖池内的单胞藻，使之维持合理的种群密度和旺盛的生长状态，是进行生态调控、保证水体正常的物质循环和能量流动的关键环节。按一般规律，绿色、黄绿色、黄褐色的单胞藻容易护养。随着单胞藻的繁殖、生长，其颜色逐渐加深，在某些情况下，甚至由绿色变成褐色。一般在盐度小于20的情况下，单胞藻颜色多为绿色。在盐度大于25的情况下，组成种类较少，易呈褐色。在养成早期，单胞藻大量死亡的主要原因是缺乏营养或二氧化碳，死亡后水面形成大量稳定的泡沫，池底废物积累，水色透明。在养成中、后期单胞藻大量死亡，主要是由于繁殖过密、水色过深、缺乏光照引起的。水质的突然变化、大雨过后或大量换水，也会引起单胞藻突然死亡。合理施肥，适量换水，适时投入水环境保护剂，保持正常浮游生物密度，是避免其大量死亡的关键措施。施肥应注意少施、勤施，以调水为目的的施肥应以化肥为主，且注意肥料种类。当水池内单胞藻种群结构不合理时，还可采取换水后临池接种繁殖的办法繁殖单胞藻。
二、应用光合细菌净化水质
光合细菌是能进行光合作用的原核生物的总称，其共同特点是体内具有叶绿素和胡萝卜素，能在无氧和有光条件下进行光合作用获得能量，但不产生氧气。光合细菌蛋白质含量高，并富含维生素B族、叶绿素及胡萝卜素等，还可以作为鱼、虾类的饵料，有改善鱼、虾体色和增强机体抗病力的功能。因此，光合细菌投入虾池中，能迅速消除水体中的氨氮、硫化氢、有机酸等有机物质，平衡酸碱度，改善池水质量。光合细菌在养殖生产中作为水环境保护剂使用，多采用拌沙法，即在养殖中、后期按每公顷15公斤～75公斤的用量与沙搅拌，泼洒于池中。也可在污染严重的池底集中投放，一般每隔15天左右投放1次。还可将菌液加入饲料中或与饲料搅拌后投喂。
投放光合细菌要注意：多菌种混合比单菌种投喂好；有机物腐败程度越高、污染越严重的池底投放效果越好；可与麦饭石、沸石等合用，效果更佳；不能与消毒剂合用，以免被杀死。
三、净水活菌净化水质
净水活菌是由多种化能异样菌组成，具有改善水质的功能，它们克服了光合细菌不能直接利用大分子有机物、不能分解生物尸体及残饵粪便等不足，兼有氧化、氨化、硝化、反硝化、解磷、硫化及固氮的作用。不仅能净化水质，还为单胞藻的繁殖提供了大量营养。上述方法可减少水产品疾病，有利于提高产品的品质。
