中草药害虫种类繁多，除受一般农作物害虫危害外，其本身还有一些特有害虫。现简要介绍如下：
（1）蚜、蚧、螨类等刺吸口器害虫：蚜虫是中草药的重要害虫类群，危害十分普遍。据调查桃蚜可危害数十种中草药。中草药还有一些特有的蚜虫种类。如危害红花、牛蒡等的红花指官蚜Uroleucon gobonis（Matsumura）、危害萝蘼科药材的萝蘼蚜Aphis asclepiadis Fitch等。介壳虫主要危害一些南方生长的中草药，尤其是木本南药受害较重，如危害槟榔的椰圆盾蚧，危害多种中草药的日本龟蜡蚧（Ceroplastes japonicus Green）等。少数中草药受螨类危害较重，如危害地黄的棉叶螨，危害枸杞的瘿螨（Eriophyes sp.）等。这类害虫吸食中草药汁液，造成黄叶、皱缩，叶、花、果脱落，严重影响中草药生长和产量、质量。有些种类还是传播病毒病的媒介，造成病毒病蔓延。由于发生量大，世代多，用药水平较高，如何防止或减少农药污染，是个值得重视的问题。
（2）地上部咀嚼口器害虫：这类害虫主要咀食中草药叶、花、果等，造成孔洞或被食成光秆。如危害伞形科中药的黄凤蝶幼虫，危害枸杞的枸杞负泥虫（Lema decempunctata Gebler），危害板蓝的青菜虫等，危害都很严重。金银花受尺蠖危害，几天内可被吃光秆，造成严重损失。
（3）钻蛀性害虫：钻蛀性害虫是中草药的一类危害重、防治难度较大，造成经济损失较大的类群。危害中草药的钻蛀性害虫主要有蛀茎性害虫如金银花咖啡虎天牛（Xylotrechus grayii White）、菊天牛、肉桂木蛾（Thymaiatris sp.）等；蛀根茎类害虫如北沙参钻心虫（Epinotialancantha Meyrick）等；蛀花、果害虫如槟榔红脉穗螟（Tirathaba rufivena Walker）、枸杞实蝇等，蛀种子害虫如黄芪种子小蜂（Bruchophagus spp.）等。
（4）地下害虫：地下害虫是主要危害植物地下部分又生活在土壤里的害虫。地下害虫种类很多，包括蝼蛄、金针虫、地老虎、根蛆、根蚜、根蚧、白蚁等，但以前四种危害最普遍。因中草药中根部入药者居多，地下害虫直接危害药用部位，致使商品规格下降，影响产量和质量。
2、中草药病害的发生特点
（1）地道药材病害严重：由于历史形成的原因，使某些药材有特定的被认为是最佳的生产地区。在这些地区生产的某种药材就是所谓“地道药材”。如东北人参、云南三七、宁夏枸杞、河南地黄、浙江杭菊、四川的川芎、甘肃当归等。这些地道药材长期生长在特定的地区。病原菌逐年积累，致使病害严重，难以控制。如东北人参锈腐十分严重，致使老参地下不能再利用，只有毁林栽参，已成一大难题。
（2）中草药地下部病害严重：中草药的药用部位，很多是根、块根和鳞茎等地下部分。这些地下部分很易受土传病原真菌、细菌或线虫危害，发生多种根部病害。如人参锈腐病、白术根腐病、附子白绢病、地黄线虫病、渐贝软腐病等。这类病害发生严重且难以控制，必须用以预防为主的综合措施加以治理。
（3）无性繁殖材料是中草药病害的重要初侵染来源：不少中草药是用根、根茎、鳞茎、珠芽或枝条等无性繁殖材料进行繁殖的。这些无性繁殖材料常受到病害侵染而成为当代植株的病害初侵染来源。因此，在生产上建立无病苗种田，精选无病种苗进行适当的种苗处理和地区间种苗检疫等工作是十分重要的防病措施。
