浅水藕的适宜水位为10-20厘米，最大耐水深度为50厘米，栽培上必须根据浅水藕不同生长期调控好水层。
浅水藕水层管理总的原则是前浅、中深、后浅。栽藕后立叶出现时保持4-7厘米浅水层，以提高土温，促进发芽。随着茎叶生长转旺，水层逐渐加深到12-15厘米。终止叶出现后植株开始结藕，水层逐渐降低到4-7厘米深，促进结藕。
浅水藕生长前期，田内眼子草、牛毛毡、矮慈姑、三棱草等杂草和四叶萍、黑藻较多，会影响莲藕生长，应及时除去。莲藕立叶高出水面30厘米时，用50%威罗生乳油100毫升、尿素5千克拌细土5千克，在露水干时撒施于田中。施药时保持藕田水深7-10厘米，保持水层1周以上，持效期可达1个月以上。或者用12.5%盖草能或35%精稳杀得40毫升，加水40-50千克，露水干时喷洒在杂草叶面上，4天后大部分3-4叶期禾本科杂草被杀死。
