生物农药由于无毒、不污染环境以及病虫不易产生抗药性等优点，被人们称之为绿色农药。目前许多地方已开始接受使用这种农药。但在使用上必须注意以下一些问题。
一是温度。生物农药喷施的适宜温度是在20℃以上，因为这类农药的活性成分是蛋白质晶体和有生命的芽孢，低温下芽孢在害虫体内繁殖速度极慢，蛋白质晶体也不易发生作用。据试验表明：在25-30℃条件下施用生物农药，其药效比在10-15℃时施用高两倍左右。
二是湿度：使用生物农药，环境湿度越高，药效越好，尤其是施用粉状生物制剂，只有在高湿条件下药效才能得到充分发挥。其原因是细菌的芽孢不耐干燥的环境条件。因此，喷撒细菌粉剂宜在早晚有露水的时候进行，以利于菌剂能较好地粘在茎叶上，并促进芽孢繁殖，增加菌剂与害虫接触的机会。
三是阳光：阳光的紫外线对芽孢有杀伤作用，阳光直接照射30分钟，芽孢便可死亡50%左右；照射1小时则死亡率高达80%，而且紫外线的辐射对蛋白质晶体也有变性作用。因此，要选择在下午4时以后或在阴天使用生物农药。
四是雨水：中到大雨会将喷洒在叶片上面的菌液冲刷掉，降低药效。但如果在施药后5小时下小雨，则不但不会降低药效，反而可提高防效。因小雨对芽孢活动有利，害虫取食叶片后会加速其死亡。
