磷对洋葱幼苗期的发育十分重要,可以直接影响株高和叶数的增加，甚至根系也会因缺磷而发育不良。在鳞茎肥大期缺磷，也会减产。如果磷素吸收过剩，则鳞茎外部的鳞片会发生缺钙；内部鳞片会发生缺钾；鳞茎盘(底盘)会表现缺镁，于是肌腐、心腐和根腐等生理病害则由之发生。
必须指出的是，一旦出现缺磷的症状后再向土壤追施磷肥已无济于事。因此，必须事先在基肥中配加磷肥；或用磷酸二氢钾液喷洒叶面补肥，作为应急措施。 钙吸收不足，则根部和生长点的发育机能会受到影响，组织内的碳水化合物也会降低；从而影响鳞茎的生长和品质，这也是导致发生心腐和肌腐病的直接原因。若钙吸收过量，会导致微量元素的失调。
