育雏前做好种蛋消毒，对提高孵化率、健雏率及雏鸡成活率、整齐度和以后的产蛋性能都有好处。常用的消毒方法有：
紫外线消毒 将种蛋置于紫外线灯下60厘米处，开灯照射10分钟，然后将蛋翻转，再从背面照射10分钟。利用紫外线消毒只能杀灭种蛋表面的微生物，对深层的微生物杀灭效果差。
高锰酸钾消毒 高锰酸钾又叫灰锰氧、PP粉，呈紫黑色结晶，有金属光泽，可溶于水，是一种强氧化剂，因能放出新生态氧而具有杀菌作用。用0.5%高锰酸钾溶液浸泡种蛋1分钟，取出沥干装盘即可。
漂白粉液消毒 将种蛋浸入含有1.5%活性氯的漂白粉溶液中3分钟，取出沥干后即可。值得注意的是，此法必须在通风处进行。
碘液消毒 将种蛋置于0.1%碘液中浸泡30～60秒，取出沥干装盘。碘溶液的配制方法：碘片10克，碘化钾15克，先将碘化钾溶入1000毫升水中，加入碘片，溶解后加入9000毫升清水即可。浸泡种蛋10次后，溶液中的碘浓度会降低，如需再用，可延长浸泡时间至90秒，或者添加新配制的溶液。
土霉素消毒 将种蛋加热到38-40℃，然后放入预先配好的万分之五土霉素溶液中，溶液的温度为4℃，浸泡15分钟。
新洁尔灭消毒 用5%新洁尔灭原液加50倍的水配制成0.1%的溶液，用喷雾器喷洒种蛋表面或浸泡3分钟即可。
