1、瓜类枯萎病：病苗子叶萎蔫，基部变褐腐烂。防治可选用向农四号等药剂。
2、西红柿早疫病：当遇阴雨天，空气湿度较大时西红柿苗期易产生“腰烂”，即早疫病。一般先发生在叶片上。开始在叶上呈现深褐色水渍状小斑点，以后扩大成圆形或近圆形，后期病斑周围发黄、中面灰褐色，有明显的同心轮纹，病部易折断。此病多发生于苗床通风不良、高温高湿或多阴雨天气。防治方法：要加强苗床管理，培育壮苗，及时清除烧毁病叶、病株，用50%扑海因可湿性粉剂1000倍、或77%可杀得可湿性粉剂600倍液每隔7-10天喷一次，连续2-3次。
3、立枯病：病菌发育适宜温度为20-24℃，病菌从伤口或直接从表皮侵入幼苗的茎或根部而使之发病。在湿度大，床土结构不好，通气差的苗床最易发病。小苗和大苗都能发病，可为害茄子、西红柿、黄瓜等幼苗，患病幼苗茎基部产生暗褐色斑。发病初期，幼苗白天萎蔫，傍晚或早晨恢复，但病斑逐渐凹陷并扩大，绕茎一周，幼茎收缩，导致幼苗死亡，但仍保持直立状态，拔出幼苗可看到基部病斑处有浅褐色，蜘蛛网状的菌丝体。可用向农四号、杜邦克露、大生、杀毒矾等药剂进行防治。
4、根腐病：为害幼苗根部和根茎。病部初呈水渍状，后呈浅褐色至深褐色腐烂，根茎不缢缩，稍向下陷。潮湿时基茎部病皮上产生粉红色的霉。防治可选用向农四号等药剂。
5、病毒病：可用病毒A、植病灵等药剂防治。
6、虫害：蔬菜苗期害虫为害不太严重，但也要及时防治，苗期害虫主要有蛴螬、蝼蛄、蚜虫以及小菜蛾等，发现田间有害虫为害时，应及时进行防治。对于蚜虫的防治，除了采用防虫网外，可用功夫或天王星乳油等药剂喷杀。甘蓝类蔬菜育苗易发生菜青虫，可用高效Bt可湿性粉剂、敌百虫和灭幼脲3号等药剂进行防治。对于蝼蛄和小地老虎除可用黑光灯进行诱杀外，可用敌百虫原粉拌炒香的麦麸制成毒饵进行诱杀。
