(1)苗期施肥 当土壤氮素(N)含量低于30毫克/千克、磷素(P)含量低于20毫克/千克时，番茄幼苗生长缓慢衰弱。因此，培育壮苗是番茄取得高产的基础。一般在播种前10-15天，在11米2的畦面上施入充分腐熟和捣碎的混合粪肥100-150千克，并掺入磷0.15～0.23千克(相当于普通过磷酸钙1.3-2千克或重过磷酸钙0.3-0.5千克)，此外，还要掺入钾0.15-0.17千克(相当于硫酸钾0.3千克左右)，与土充分掺匀。也可在播种前在苗床(11)上施用氮、磷、钾(15:15:15)复合肥1千克与土掺匀，对促进壮苗、提高坐果及产量均有良好效果。
如果采用营养块或营养钵育苗，在移栽时伤根少，缓苗期短，可增加前期产量。培养土的配制，选用草炭50％～60％，马粪25％～30％，园田土15％～20％；或用草炭20％～30％，厩肥20％～30％，园田土50％～60％，充分混匀后填入苗床，喷水、切块或装育苗钵备用。
(2)定植前施肥 定植前重施腐熟肥，每公顷施用优质农家肥75-105吨；磷90～120千克，相当于普通过磷酸钙750-975千克或重钙195-255千克；钾112.5-150千克，相当于硫酸钾225-300千克。在施用氮肥的基础上增施磷、钾肥可取得明显的增产效果。
(3)定植后追肥
①催苗肥：定植后浇第二次缓苗水时，每公顷可追稀粪水7500千克或追施氮(N)15-30千克，相当于尿素30-60千克或硫酸铵70.5-142.5千克或硝酸铵43.5-87千克。在土壤肥力不高，底肥不足的情况下，催苗肥是很重要的。
②促果肥：在第一穗果开始膨大时结合灌水追施肥料，这次肥料占总追肥量的30％～40％，一般每公顷施人粪尿7500-15000千克，或氮(N)45-60千克，相当于尿素90-135千克或硫酸铵210-285千克。此后不要再用硝酸铵作追肥，以减少氮素淋失和果实中硝酸盐的积累。
③盛果期追肥：番茄进入盛果期，营养体和果实量均迅速增加，如果此时期肥料不足会引起植株早衰，果实发育不饱满，果肉薄，品质差。一般在第一穗果发白到第三穗果迅速膨大这一段时间内，追肥2-3次。每公顷追施氮(N)75-150千克，相当于尿素165-330千克或硫酸铵357-714千克。此外，还可以结合农药喷施0.3％～0.5％尿素、0.5％磷酸二氢钾、0.5％～0.8％硝酸钙2-3次，对保持后期产量和减少果实病害有益。
