大水面养鱼由于水体面积较大,防治鱼病有一定难度。大水面施药，既不经济，又容易造成水体污染。采用以下六种方法可有效防治病害的发生。
鱼种消毒法：大水面养鱼必须在投放鱼种季节选择体格健壮的大规格鱼种，经过药物消毒后方可投放。常用的药物有漂白粉、鱼用敌百虫、食盐、亚甲基蓝等，这些药物对鱼类体表和鳃部的细菌、寄生虫都有一定的杀灭作用。
饵料消毒法：病原体往往随饵料被带入鱼体，所以投喂的饵料必须清洁、新鲜，最好能经过消毒处理。动物性饵料如螺、蚬等要用清水洗净，选取鲜活的个体投喂；植物性饵料如水草、陆草，则应放在6毫克/升的漂白粉溶液中浸泡20~30分钟后再投喂；施用有机肥料，应在1000千克粪肥中加漂白粉200克，搅拌均匀后再投入水中。
药物挂袋法：药物挂袋必须先设置好固定食台，使鱼养成定位吃食的习惯。如饲养的是草食性鱼类可用竹竿做成三角形或多边形框架，搭成漂浮性的水面食台。要定期用药物挂袋（一般每隔20~30天一个疗程），漂白粉挂袋每袋100克，每天换一次，连续3天；硫酸铜、硫酸亚铁挂袋，每袋硫酸铜100克、硫酸亚铁40克，每天换一次，连续3天。药袋应挂在食台周围，每个食台可挂3~6个袋。
投喂药饵法：大水面生长的草鱼、青鱼容易患肠炎病，在发病季节（每年5－10月）用二氟杀星进行预防，第一天第一次按吃食鱼体重每10千克用二氟杀星药粉1克计算，以后每天投量减半，用次面粉等做成黏合剂制成药饵投喂鱼类。另外，用大蒜拌草或食盐浸草喂草鱼预防传染性疾病的效果较好。
中草药防治法：中草药可就地采集，来源广、成本低、效果好，无毒副作用。如马尾松叶可防治草鱼的肠炎病和烂鳃病；乌桕叶、大黄根茎可防治鱼类的烂鳃病、白头白嘴病；地锦草、铁苋菜可防治草鱼、青鱼的肠炎病和烂鳃病；楝树根茎叶可防治鱼类寄生虫病；土荆芥、贯众可防治鱼类的毛细线虫病；另外中草药的根、茎、叶腐烂后又可肥水。
控制施肥法：大水面养鱼必须控制人工施肥的数量，为了保证水域生态平衡，一般不提倡过量施用有机肥料和无机肥料。过量施用人畜粪，鱼类容易感染寄生虫病；过量施用化肥，浮游生物会突然大量繁殖，高温期间容易导致暴发性鱼病的发生。
