甘薯软腐病为甘薯采收和贮藏期的主要病害之一。在甘薯含水量高时，贮藏期间极易生软腐病，如不加以重视，就会造成红薯大量腐烂。主要防治措施如下：
适时收获，避免机械损伤。夏薯要在霜降前后收完，秋薯要在立冬前收完，要选晴天收获，挖薯时尽量减少或避免产生伤口。
精选健薯，做到安全入窖。在甘薯入窖前要精选，淘汰病、残、烂薯，水气晾干后入窖，尽量用新窖。旧窖用前要把窖内旧土铲除露出新土，也可每平方米用硫磺15克进行熏蒸消毒杀菌。
加强管理，降湿、保温和通风。贮藏前期，即入窖后30天内，这段时间的主要工作是通风、保温和散湿，温度控制在15℃以下，湿度控制在90%-95%。利用通风孔或门窗，有条件的利用排风扇，加强通风。如果白天温度高，可以采取晚上打开、白天关闭的方法；以后随着温度的逐渐下降，通风孔可以日开夜闭，待窖温稳定在15℃以下时可不再通风。
贮藏中期，即前期过后到立春的这段时间，窖温降低，是薯块最容易受冷害的时期，保温防寒是这段时期的工作重点，使窖温不低于10℃，最好控制在12℃-14℃。封闭通风孔或门窗，加厚窖外保温层，薯堆上覆盖草垫或软草。
贮藏后期，即开春以后（3月份）外界气温逐渐升高，要经常检查窖温，保持在10℃-14℃，中午温度过高及时放风，傍晚及时关闭风口，使窖温保持在适宜范围之内。
