大棚、温室甜瓜病害发生流行必须具备3个条件：一是易感病的甜瓜植株，二是一定数量的病原物，三是适宜发病的温湿度条件。因此，防治甜瓜病害应做好以下4项管理。
1、减少病原物。减少生长环境中的病原数量，是预防病害发生的根本措施。选地时忌用老苗床土壤，选用3年以上未种过瓜类的肥沃土壤育苗。床土要消毒，施用的肥料要充分腐熟。加强检疫，在无病区生产和调运种子，防止种子带毒。播前进行种子消毒，定植前细致检查，淘汰病弱苗。选3-5年未种瓜类的大棚、温室栽培，棚内苗床喷洒广谱杀菌剂，实行轮作、合理间作。棚室周围的大田尽量不种其他瓜类作物。在播种或定植前10-15天，用45%百菌清烟剂250克点燃消毒。甜瓜生长期间及时清除杂草，拔除病株，带出田外深埋或烧毁。甜瓜拉秧后及时清理残株深埋或烧毁。
2、控制发病环境。播种前定植后要浇足底水，缓苗后浇足缓苗水。生育期如需浇水，应开沟灌小水，忌大水漫灌。棚面覆盖无滴膜，地面覆盖地膜。采用大小行栽培，合理密植，及时通风，尽量降低环境湿度。甜瓜霜霉病发病适宜温度为20-22℃，在栽培中避开这一温度即可避免病害的发生，大棚、温室夜间可保持15-18℃，早晨迅速提高到25-28℃。
3、加强田间管理。选抗病品种，利用黑籽南瓜作砧木嫁接，可提高植株抗枯萎病的能力。保证水、肥供应和光照充足，适时整枝搭架，及时采收。根外追施营养元素，提高植株抗病力，用白糖与尿素混合液（白糖50克、尿素50克、水15公斤），5-7天喷雾1次。根外追施0.2%磷酸二氢钾亦有防止病害发生的作用。
4、药剂防治。发病初期及时防治，农药以生物制剂为好，其次是低毒、低残留农药。如防治细菌性病害应选用 72%农用硫酸链霉素4000倍液，或14%络氨铜200倍液。防治叶面病害可选用45%百菌清或10%速克灵烟雾剂，用药量每亩棚室250克。病毒病在发病初期喷病毒A500倍液，或1.5%植病灵800-1000倍液、或0.5%抗毒剂1号300倍液，也可使用银灰塑料膜或黑塑料膜避蚜防病。
