一、母源抗体。不按说明书规定，提前免疫，导致雏禽母源抗体水平提高，母源抗体中和疫苗病毒影响产生免疫力，疫苗不能接种过早。
二、疫苗质量。⑴疫苗虽未到失效期，但未按要求贮藏、运输或停电使疫苗反复冻融，疫苗中微生物死亡而失效。⑵疫苗微生物在保藏中，随时间延长，细菌和病毒死亡越来越多，免疫时即使加大剂量，也达不到效果。
三、选择疫苗不当：疫苗品系不同，毒力也不相同。若首免品系毒力强，不但不起免疫保护作用，反而引起发病；在疫病流行严重地区，选用安全性好但免疫力低的疫苗品系，产生的抗体不能抵御强毒攻击，导致免疫失败。
四、使用疫苗不当。⑴多数疫苗可用生理盐水、蒸馏水稀释，但个别需专用稀释剂，否则会降低疫苗效价，甚至完全失效。⑵在免疫接种时饲料中添加抗菌药及舍内喷洒消毒剂，活毒苗被直接或间接干扰，灭活苗也不能充分发挥免疫能力。⑶盲目联合应用疫苗，如在同一时间内用新城疫疫苗点眼，传染性支气管炎疫苗滴鼻，鸡痘疫苗刺种，当多种疫苗进入体内后，部分疫苗产生的免疫被免疫成分强的所遮盖，相互干扰导致免疫失效。⑷免疫剂量不准，量不足，不能激发机体产生免疫反应；量太多，产生免疫麻痹使免疫力受到抑制。⑸免疫途径不当，会直接影响免疫效果。如传染性法氏囊病采用滴鼻免疫就不正确了，应采用饮水免疫。⑹疫苗稀释后，要在30-60分钟内用完；稀释的疫苗超过3个小时再接种，对机体的保护率为零。⑺免疫接种不细致，如采用饮水免疫时饮水不足，稀释疫苗时计算错误或疫苗浓度不均匀，应接种的禽只不能全部接种等。
五、早期感染。接种禽群已有强毒病原微生物潜伏体内，或者接种人员及用具消毒不够好，导致强毒病原微生物侵入。
六、应激及免疫抑制。饥渴、寒冷、过热、拥挤等不良因素刺激，抑制体液免疫和细胞免疫，导致疫苗免疫保护力下降。试验表明，传染性法氏囊病病毒的感染可使马立克氏病火鸡疱疹毒疫苗的免疫力下降20-40%，已接种马立克氏病疫苗的鸡群感染了传染性法氏囊病病毒后，再发生马立克氏病的比率超过没有感染传染性法氏囊病病毒鸡群的7倍以上。
七、血清型。有的病原微生物有多个血清型，在选择疫苗的时候必须考虑当时流行疫病的毒株，如果疫苗的血清型与感染的病毒或细菌血清型不同，则免疫后起不到保护作用。
八、超强毒株。马立克氏病毒存在超强毒株，火鸡疱疹病毒苗对其免疫效果很差。
