在生产实践中，农作物往往会受一些因素影响，可能造成与药害相似或相同的症状。在药害鉴定时，必须仔细加以辨别，以防作出错误的结论。
作物病害有些作物病害的表现症状与药害很相似，如番茄病毒病发生时出现的花叶、卷曲等，桃缩叶病发生时出现的叶片增厚、变脆等，叶尖干枯更是许多病害的常见症状。
作物虫害作物受到害虫为害后，会造成卷叶（如蚜虫为害），叶片出现失绿点或发红（如红蜘蛛为害），甚至造成落叶（如麦类作物受麦秆蝇严重为害）。
营养缺乏或施肥过量一般情况下，作物缺氮会引起黄叶，甚至出枯斑。施肥过量会造成叶片烧伤或叶尖干枯。
环境条件在不良的环境条件下使用农药容易产生药害，但在不使用农药的情况下不良环境条件也可以给作物造成类似药害的伤害，如冻害和高温都可以造成某些作物嫩芽、叶片、花的伤害；长期干旱可以使作物生长不良，植株变小变矮、萎蔫、叶尖叶缘坏死；干热风可以使部分小麦品种出现叶尖干枯的情况；有害气体可以使植物叶片发黄，植株萎蔫甚至整株死亡；用含有有害物质的水来灌溉，可使作物生长停滞，甚至死亡；土壤透气情况严重不良，也会影响作物的正常生长等等。
