土壤是蔬菜优质高产最重要的物质基础，但随着设施蔬菜的大面积发展，土壤恶化现象越来越严重。土壤恶化主要体现在土壤板结、盐渍化加重、微量元素缺乏、土壤菌群失调等方面。
一、土壤板结、盐渍化加重
危害：在大部分菜区，都存在长期大量不合理施用化学肥料的现象，表现为：不但底肥化肥使用量大，而且追肥也是大量使用，这样就使得土壤团粒结构破坏严重，透气性降低，需氧性的微生物活性下降，土壤熟化慢，从而造成土壤板结。土壤板结对蔬菜的危害一是根系下扎困难，二是即使根系能扎下去，也会因土壤含氧量过低，出现沤根现象。土壤盐渍化是指长期过量施用化肥后，土壤中盐离子增多，妨碍蔬菜根系正常吸水，从而影响植株生长，严重时蔬菜就像种在盐水里一样，造成了腌根死棵。土壤盐害有轻重之分，初期地面有清霜而后发展到绿皮“青苔”，棚室内蔬菜尚为正常；中度时地面出现许多块状的红色胶状物，干后变为“红霜”，棚室内蔬菜生长到中期出现点片萎蔫；土壤盐分过重时地面出现白色结晶“盐霜”，棚室内蔬菜定植后根系特别少，后期死秧加重。
解决措施：目前解决土壤板结和盐渍化较好的措施是使用汽巴松土精，每亩地300克，使用时将松土精掺30～40公斤土撒施到蔬菜的根部附近，然后浇水即可。使用松土精后，通过松土精的物理作用，改善土壤的团粒结构，使土壤疏松、透气，促进蔬菜根系下扎，保证蔬菜对养分和水分的吸收。
二、土壤菌群失调
危害：土壤中的生物菌有一部分是有益菌，在土壤中起比较好的作用，改良根系生长的环境；还有一部分菌属于有害菌，这些菌会引起许多的土传病害，造成死秧、死苗。随着种植时间的延长，土壤中有害菌的数量越来越多，而有益菌得不到补充，这就导致了土壤菌群的失调。
解决措施：要想解决土壤菌群失调的问题，单靠使用杀菌剂来杀死土壤里面病菌的办法是行不通的，只能想办法补充土壤里面有益菌的数量，使土壤当中的有益菌和有害菌重新达到一个平衡，就不会影响蔬菜的长势了。目前补充土壤有益菌可使用家园益微增产菌，每亩使用500克+50克助剂(助剂的目的是养菌)，掺土30～40公斤，根据地块情况，一个生长季节使用1～2次。
三、微量元素缺乏
危害：连作是蔬菜种植的普遍现象，然而连年种植蔬菜容易造成土壤养分的偏耗，特别是硼、锌、铁等微量元素，由此引发的缺素症越来越严重，大大影响了蔬菜的生长发育，产量减少、品质下降。
解决措施：补充微量元素一要选对产品，二是选好使用时间，三是掌握用量。无论是果菜类还是叶菜类，微量元素补充有3种办法：
1.底施：底施优力硼锌+瑞绿。优力硼锌补硼补锌，每亩用量为200克；瑞绿为EDDHA螯合态最稳定的铁肥，每亩地用量50克。在整地施肥时，把优力硼锌和瑞绿混合均匀，结合其他肥料共同施入。
2.冲施：冲施瑞培乐。瑞培乐里面含铁、铜、锰、锌、硼、钼6种微量元素，含量全，利用率高，使用量少，每次每亩追施100克即可，配合冲施肥，补充各种元素，解决各种缺素症，平衡蔬菜吸收氮磷钾的比例，改变蔬菜品质。
3.叶面喷施：叶面喷施微量元素适合于缺素症较轻的生理病害，而且为了保证其吸收率，应选螯合态较好的微肥。补硼选用瑞培硼、补锌选用瑞培锌、补钙选用瑞培钙、补铁选用瑞绿。注意叶面喷施微量元素时，配合果蔬宝750倍液(内含稀土等)共同使用，效果更佳。
