目前秸秆还田有多种形式，可分为5大类：秸秆粉碎翻压还田、秸秆覆盖还田、堆沤还田、焚烧还田、过腹还田。这5种形式各有利弊。
一、秸秆粉碎翻压还田 这种秸秆还田形式，就是把作物收获后的秸秆通过机械化粉碎，耕地，直接翻压在土壤里。这样能把秸秆的营养物质充分的保留在土壤里，但也有不足之处，主要表现如下：
1、由于秸秆还田量过大或不均匀易发生土壤微生物（即秸秆转化的微生物）与作物幼苗争夺养分的矛盾，甚至出现黄苗、死苗、减产等现象。所以，一般每667平方米秸秆粉碎翻压还田不宜超过300千克，最多不超过500千克，否则，会影响秸秆在土壤中的分解速度及作物产量。因此在秸秆直接还田时，一般还应适当增施一些氮肥，缺磷的补施磷肥。
2、秸秆翻压还田后，使土壤变得过松，孔隙大小比例不均、大孔隙过多，导致跑风，土壤与种子不能紧密接触，影响种子发芽生长，使小麦扎根不牢，甚至出现吊根。我们应该采取的措施是适时灌水，或碾压，使土壤与种子接触紧密，能够正常发芽。或者是加大粉碎细度，最好达到3.5厘米以下。
3、易发生病虫害。秸秆中的虫卵、带菌体等一些病虫害，在秸秆直接粉碎过程中无法杀死，还田后留在土壤里，病虫害直接发生或者越冬来年发生。因此应采取有效的措施进行处理。
二、秸秆覆盖还田 这种方式就是秸秆粉碎后直接覆盖在地表。这样可以减少土壤水分的蒸发，达到保墒的目的，腐烂后增加土壤有机质。但是这样会给灌溉带来不便，造成水资源的浪费，严重影响播种。这种形式适合机械化点播，也比较适宜干旱地区。
三、堆沤还田 堆沤就是使作物秸秆充分高温腐熟以后，施入土壤，堆沤方式有的是通过家畜圈，有的是加上生物菌、水等进行。这样利于植物体的吸收。但是秸秆在腐熟的过程中，氮素有一定量的流失，这种形式费工、费时、占地，现在一般农民利用很少。
四、焚烧还田 秸秆经焚烧，有效成分变成废气排入空中，大量能源被浪费，剩下的钾、钙、无机盐及微量元素可以被植物利用，并且在燃烧过程中杀死了虫卵、病原体及草子。但是焚烧造成资源浪费、环境污染、生态破坏，同时影响交通及百姓生活，已成为一大公害。要坚决采取措施禁止焚烧。
五、过腹还田 这种形式就是把秸秆作为饲料，在动物腹中经消化吸收一部分营养，像糖类、蛋白质、纤维素等营养物质外，其余变成粪便，施入土壤，培肥地力。而秸秆被动物吸收的营养部分有效地转化为肉、奶等，被人们食用，提高了利用率，这种方式最科学，最具有生态性，最应该提倡推广。
秸秆还田好处多多，但是弊处也有。是否实行秸秆还田，采取哪种方式还田，要根据本地、本户、本地块的实际情况而定，切不可一刀切。另外，如果但当地畜牧业发展较好，饲草缺乏，则不宜推广和施行秸秆还田措施，因为秸秆是牲畜的良好饲料，利用秸秆饲喂牲畜，可以大大降低饲料成本，使牲畜安全越冬，促进畜牧业发展。
