大棚用肥的种类繁多，按照使用类型分为有机肥、无机肥等。按使用方法分为基肥、追肥。寿光棚菜基肥一般是鸡、鸭、猪肥，豆粕、大豆并辅之部分化肥。用什么样的肥料、用多少，应注意哪些事项，笔者根据近年来的考察，提出以下几点建议。
一、各类肥料的特点
(一)畜禽粪肥养分全，适当增施能高产。畜禽粪肥的养分含量全面，有机质和大、中、微量元素几乎都有，特别是有机质含量能达到90%以上，对于改良土壤，养根发棵，优质高产至关重要。畜禽粪肥属迟效肥料，肥效持久而缓慢，需要在微生物分解转化以后才能供作物吸收，在冬春季节，一般需要15- 20天才能发挥肥效。因为后劲足，所以能抑制早衰。因为畜禽肥料含有较多的氨基酸和芳香族类物质，适当增施对果实的颜色、光泽、酸甜度都有较大的影响，坚持使用畜禽肥料，果实甜香好吃就是很好的证明。
畜禽粪肥所含矿质养分不是太高，即磷、钾、钙、镁等都是有限的，尤其是氮素在腐熟过程中大量流失，含量不足，远远不能满足作物盛果期的需要，因此要把握好两点，一是施肥数量要大。按寿光的经验做法，一般每亩地基施10方左右。二是初果期以后要及时追施化肥，补充化学元素的不足。稻壳鸡鸭粪养分含量更低，每亩基施20方以上也是可以的，但连续多年大量施用，能造成土壤深层土传病害加重，作物主根系黑褐色坏死。禽畜粪肥不能鲜用，必须经过充分腐熟后施用，通过腐熟能杀灭大部分有害菌和害虫卵，并能使有害气体分解排放，否则肥害烧根，有的能造成重大损失。腐熟之后的禽畜粪不但能做微肥，也是很好的追肥，随水冲施多次，对于防早衰增产效果显著，其优点是化肥不能比拟的。禽畜粪肥做基肥或追肥，最好与三元复合肥配合施用。
(二)生物菌肥作用大，改土养根要靠它。
随着大棚菜的重茬种植，土传病害和自毒物质的积累日趋严重，尤其是土壤颗粒吸附的矿质元素越来越多，呈现不溶解态的化合物，引起土壤盐渍化。要改变土壤恶化的态势，单纯依靠化学农药进行土壤处理，显然是难以做到的。通过生物菌肥的施用，可以有效地解决土壤问题。首先，菌肥中的芽孢杆菌或酵母菌等，如果达到足够的数量，就会形成一定的有益菌群，有益菌群在作物的根际一是能限制有害微生物的繁殖侵染，抑制或“吃掉”有害菌，所以具有防治土传病害的作用。二是芽孢杆菌等能分解作物的自毒物质，也能分解土壤中已被固定的矿质元素，使多年不能被作物吸收的营养被重复激化利用，因而土壤中的含盐量也就逐渐减少，达到减轻盐渍化的目的。
生物菌肥中的有效菌数量，即活菌数是判断菌肥优劣的重要指标，一般以含活菌数每克达到2亿个以上的为好。活菌数与菌肥的母液或基质密切相关，如果基质含有较多的氮磷钾，活菌数就不可能太高，因为PH值的变化和基质的营养不足可能使有益菌不能存活。另外，土壤水分和地温也是限制生物菌作用的重要因素。购买生物菌肥时，一是要看品牌，如激抗菌968，三炬微生物菌剂，大源、三忠微肥等。二是看有益菌的含量，一般来说，活菌数越多越好。三是看出厂日期，半年期以内的比存放时间长的含量高。
生物菌肥的施用有基施、穴施、沟施和冲施，施用时要注意土壤湿度，当土壤湿度较大时，生物菌才能繁殖和扩展。其次是土壤温度要适宜，地温太高太低都能影响有益菌的存活和作用，一般超过35℃或低于12℃是不适宜的，所以用了生物菌肥后不能进行高温闷棚。再是生物菌肥可以和有机肥混施，有机肥同时作为有益菌的基质，为其提供更多的营养而增强其活性，但与化肥混施时一定要慎用，尤其是穴施、沟施和冲施时，化肥用量一定要少。另外，使用生物菌肥后，一般不能用杀菌剂进行灌根和冲施，特别是抗生素和铜制剂类。
(三)、化肥养分含量高，适时追施见效快。从现代的化肥工业兴起之后，化肥具有养分含量高，速效性好的特点，对作物的增产作用具有划时代的意义，在整个大棚用肥总量中，按有效成分计算，可以达到总供肥量的80%以上，一般以追施和根外追肥为主。
从作物的需肥规律讲，16种必需元素是必不可少的。构成植物体的主要元素是碳、氢、氧，占植物体总重量的40%以上，它的来源是空气和水，而其它13种元素几乎都可以用化肥来进行补充。并且无论什么优质的有机肥，通过微生物的作用，也要转化为供作物吸收的矿质元素才行，从本质上讲，一切的肥料，本身含有的或转化形成的，最终必须成为以上16种元素才能被作物吸收利用。之所以化肥具有直接的速效性原理就在于此。因此，大棚以化肥促进蔬菜生长，形成比较高的产量也就势在必然了。
从发展的趋势看，大棚使用单一元素化肥的方式越来越落后，菜农从生产实践中也逐渐认识到，作物吸收肥料是有比例的，是多种营养元素同时吸收的，必须按照作物的需肥规律进行配方施肥才科学合理，所以多元素复合肥，控释肥、缓释肥也就应运而生。
叶菜类属喜氨的作物，单一追施氮肥即能形成较高的产量，而茄果类类、豆类蔬菜，它们生长发育的全过程氮磷钾所需要的比例大体为2：1：4，也就是要以钾素为主，有经验的菜农往往多选用高钾的复合肥施用。实践证明，硝态氮更有利于作物的吸收，氮态容易被土壤固定，效果差，浪费大。磷肥因移动性差，容易被土壤固定，要以基施为主，可以在深翻时一次性施足，在追肥时以低含量的复合肥为好。钙镁元素作物需求量也很大，但它们的来源主要是土壤和水，中国北方广义上讲，这两种元素是充足的，不需要施用。为什么会缺钙、缺镁呢？往往不是因为土壤缺而形成缺素症状，而是因为作物对钙镁的吸收和运输受阻出现生理失调造成的。例如土壤干旱或根腐病就很容易引起脐腐病或下部叶片发黄，因此，单纯购买使用钙、镁肥是不必要的，适当进行叶片喷施即可。
微量元素的定义说明，作物生长离了不行，多了容易受害，即产生副作用。缺铁能导致嫩叶发黄，特别是石灰性土壤中很容易发生黄叶病。缺硼能引起作物花而不实。缺锌产生黄叶和“小叶病”。土壤化验说明，我国北方容易缺少这三种微量元素肥料，至于锰、铜，一般通过喷药过程就已经饱和，甚至超标，不提倡基施或追施。微量元素作基肥时，一般每亩施用1-2公斤即可，如果叶面喷施，可兑成0.1-0.3%的溶液，整个生长期喷用2-3次为宜。
