合理使用兽药：首先，应严格掌握兽药的适用症，如使用抗菌药物前应尽可能做病原检验，有条件的进行药敏实验，作为选药和调整用药的参考。其次，应选择合适的剂量和疗程，既要避免剂量过大造成药物浪费和毒性反应，又要避免剂量不足所致的病情迁移、复发和耐药性。疗程尽量缩短。再次，一种药物能控制的感染，不要随意使用几种药物。可用窄菌谱的，不用广谱药。最后，要严格掌握预防、治疗和促生长药物的品种剂量、时程和所需条件，不要将易产生耐药性的药物低剂量、长时间添加使用。病原耐药性一旦产生后，并不一定稳固，停用有关药物后，敏感性可能会逐渐恢复 （如细菌对庆大霉素的耐药性）。因此，要根据变化迁移情况，有计划地将兽药分期分批交替使用，这对防止或减少耐药性有较好作用。
防止耐药病原体交叉感染：对被耐药菌感染的畜禽，要使用有效的药物予以治疗，直到畜禽痊愈。畜禽出栏和转群后要彻底消毒。对耐药菌感染的场地、栏舍、车辆、用具及废弃物等，更应严格处理。对饲养员、兽医及动物经常接触的人员，要定期检查带菌情况，发现携带耐药菌的要严格消毒和治疗处理，并应暂时调离岗位，避免耐药菌传播给他人和其他畜禽。
