无公害果品生产须以有机肥和配方施肥为主，尽量减少和限制化肥的施用量，以增加土壤有机质含量，提高土壤保肥保水能力。
基肥主要以农家肥，如鸡粪、圈肥、厩肥或绿肥为主，配合部分速效化肥如过磷酸钙、微量元素肥料等。施肥时根据不同果树可采用放射状沟施、环状沟施或条状沟施，这样不仅增加了肥力，而且深翻了土壤，极有利于促进根系的生长。
追肥主要是以有机肥和化肥合理混合使用，花前施含氮高的肥，花后施氮、磷、钾及微量元素较充足的肥。追肥方法可采用放射沟、穴施、叶面喷施或输液法。
此外，采用果园覆草也是提高果品产量与质量的可行措施，即是用作物秸秆、杂草为原料在树盘覆草15－20cm。据北京市平谷县果品办公室对此项技术实施效果的调查结果表明，覆草园产量较对照园提高10.5%，一、二级果率提高11.3%－18.6%。
