有些农户在种植杂交油菜时，基肥施用量严重不足，农家肥很少，化肥施用存在重氮轻磷钾的现象；施追肥不及时，次数少，用量不够，只追施速效氮肥，不追施磷钾肥和有机肥；极少施用腊肥、薹肥和花肥；不重视施硼肥，甚至不施硼肥。
种植杂交油菜，应坚持基肥足、苗肥早、薹肥稳、花肥巧的施肥原则。
基肥一般每亩施猪、牛、羊栏肥等有机肥1500-2000公斤，尿素20公斤，过磷酸钙30-40公斤、氯化钾30公斤、硼肥1—1．5公斤，或用等量的有机肥加配25％(10-6-9)油菜专用复混肥(含硼)50-60公斤。
苗肥以氮肥为主，施肥要早，一般在油菜移栽活棵后及时追施第一次苗肥，每亩用尿素6公斤或碳酸氢铵15公斤，加水或稀薄人畜粪水500公斤浇施；第二次在油菜开盘期施用，用量酌加。对于长势差的油菜，视苗情增加追肥施用次数。
腊肥以有机肥为主，在入冬以前(12月下旬至次年1月上旬)用土杂肥、厩肥、人畜粪、火土灰等撒施于油菜行间，通过浅中耕拌入土层，增温防冻，生长旺的应早施。
薹肥根据油菜长势长相确定，施用时间一般在2月初，一般每亩用尿素3-5公斤加水穴施。
花肥一般采用根外追施方法，每亩用尿素1.5公斤和磷酸二氢钾0．15公斤加水75公斤于初花期喷施，长势好的田块可不施尿素。
硼肥施用要早。缺硼时，油菜苗期会出现不长新叶，叶脉褪绿转黄，叶柄细长，叶片上有紫红色斑块，根系弱，根皮变褐色甚至根颈膨大等症状；到了花期，出现叶片肥厚。叶边倒卷，叶面凹凸不平，花枝畸形(或矮化或伸长)，花粉发育不正常，只开花不结实或籽粒极小等现象，造成油菜减产。为保证杂交油菜优质高产，必须施用硼肥，一般每亩用硼砂1．2—1．5公斤，以基施为主；中后期如果出现缺硼症状，在油菜现蕾期，最迟不能超过抽薹期，选晴天每亩用硼砂0.1-0.15公斤加水喷施。
