蔬菜真菌病害非常多，同一病原物在不同的作物或在同一作物的不同生长发育时期或不同环境，其症状表现都会有所不同。相反，不同的病原物可能引起相同的症状。因此，单凭症状作出判断，并不完全可靠，必须进一步鉴定病原生物，才能确认。
真菌可用直接镜检和保湿后镜检。直接镜检：用针挑取罹病组织表面霉层，置于滴有无菌水的载玻片上，用低倍显微镜观察。保湿后镜检：切取罹病组织一小段，经表面消毒后，置于玻璃培养皿内保湿培养24小时，挑取霉层在显微镜下，观察真菌有无，形状大小，初步诊断是否为真菌病害。在保湿过程中，常有腐生菌伴生，需加以区别；有的病害表面不易见到孢子或子实体，虽经保湿培养也未能产生孢子的，需要进行专门分离培养。
