要想有效控制牛场环境，除合理规划布局牛场外，还应采取相应措施妥善处理粪尿及污水，绿化环境，防止蚊蝇滋生。
一、制取沼气。利用牛粪尿产生沼气，是我国农村推行的集能源建设和环境建设为一体，并且有经济、社会，环境等综合效益的系统工程， 可获取沼气及沼液、沼渣等沼肥，是牛场综合利用的一种最好形式。
二、作为肥料。牛粪尿中含有机成分较多，是优质的有机肥料，使用后其肥效持续时间长，是我国农村主要的肥料来源之一。
1、牛粪尿作为肥料直接施入农田。将鲜牛粪、垫草等直接施入农田，然后迅速翻耕土壤，使粪尿、垫草在土壤中进行分解发酵，使寄生虫、病原体的抵抗力降低从而失去活性，此法每1公顷土壤可施鲜粪20000千克或更多。但是土壤自净能力是有限的，如粪尿施用过多，超过土壤的自净能力，就会造成土壤的污染。因此用土壤还原法处理鲜粪时，最好加入对农作物、人畜无害的化学药物或杀虫剂进行无害化处理。患传染病的病牛粪便不宜直接施用，应做深埋处理或经长时间的堆肥腐熟后再施用。
2、腐熟堆肥法。利用好气性微生物分解牛粪便与垫草等固体有机废弃物，杀死细菌和寄生虫卵，并能使土壤直接得到腐殖类肥料。堆肥中微生物的生长需要的碳氮比为26~30：1，牛粪为 22：1，再加上垫草的混入，其碳氯比大致相当。在好气发酵的环境下，2周即可达到均匀分解、充分腐熟。
三、用牛粪栽培蘑菇后再做肥料。蘑菇（又称双孢蘑菇）营养丰富，味道鲜美，有“素中之肉”的美称。我国生产的蘑菇，80%用于加工罐头出口，在国际市场上享有很高的声誉，是出口创汇产品之一，每1千克蘑菇罐头可换回约16千克小麦和约27千克化肥。可见用牛粪发展蘑菇的生产前景很广。
四、污水循环利用。牛场污水可经过机械分离、沉淀、生物过滤、氧化分解等环节处理后，可循环使用，既减少了对环境的污染，节约用水开支，又利于疫病防治。处理方法可归纳为物理法、化学法和生物法。处理程度按两级处理。一级处理为预处理，是应用物理法从污水中除去悬浮状态的有机物转化为稳定的无害物质。经过两级处理的污水，一般能除去90%~95%的固体悬浮物，90%左右可降解的有机污染物，能大大改善水质。
五、加工复合肥料。牛粪经过堆放或人工发酵池发酵后，晒干或烘干、粉碎、过筛。根据用于不同作物，如果树、蔬菜、花卉等对肥力的不同要求，添加相应的氮、磷、钾等成分，制成相应的专用复合肥。
