板蓝根有清热解毒、凉血止血等功效。其煎剂对革兰氏阴性和阳性细菌都有抑制作用。根的丙酮提取物也有抑菌作用。板蓝根治鱼病，安全且效果也不错。
一、防治草鱼出血病。发病季节到来前1个月起，每半月投喂1个疗程的板蓝根、穿心莲合剂，预防出血病有特效。具体做法是：第一天，按每100公斤鱼用板蓝根2.5公斤、穿心莲1.5公斤加开水浸泡1小时，取汁加食盐0.5公斤，然后拌入麦麸或玉米粉4公斤做成药饵投喂；第二天取第一天留下的药渣放锅中加水煎1.5小时，取汁按第一天的方法再投喂1次。或者每100公斤鱼每天用0.5公斤大黄、黄柏、黄芩、板蓝根及0.5公斤食盐拌饲投喂，连喂7天，防治草鱼出血病。或者用板蓝根70%，苦木30%按比例混合，每100公斤鱼每月投药饵2.5~5公斤，其中每用药粉0.5公斤，加磺胺类药物5~10克，连续投喂5~7天。
二、防治草鱼细菌性烂鳃与肠炎并发病。先按每亩一米水深用生石灰15公斤全池遍洒，然后每亩一米水深用黄边须根50克、板蓝根100克，加水2.5公斤煎煮成药汤，再用药汤煮大米或稻谷喂鱼，每天1次，连喂2天。病情严重者，连喂3~4次。
三、防治长吻鱼危赤皮病、烂鳃病与肠炎病并发症。每100公斤鱼用板蓝根、黄连、半枝莲、穿心莲、侧耳根、茅草根、甘草汁100克按适当比例配伍煎汁，加入土霉素2克，均匀拌入饲料中投喂，每天1次，连喂5天，结合外用杀菌消毒药物等可有效防治此病。
四、防治甲鱼鳃腺炎病。用大青叶20PPM、板蓝根40PPM水煎剂全池均匀泼洒，可有效防治甲鱼鳃腺炎病；病情严重的甲鱼注射复方大青叶和板蓝根注射液，剂量为2毫升/公斤，每日2针，然后将其浸入60PPM的大青叶、板蓝根合剂中(1：2)，疗效显著。
