褐腐病又名湿泡病、有害疣孢霉病，病原菌为有害疣孢霉。
褐腐病发病症状：一种是发菌期间病菌侵入后，菇床表面形成一堆堆白色绒状物，颜色由白色渐变为黄褐色，表面渗出褐色水珠，最后在细菌的共同作用下腐烂，并有臭味产生；一种是原基分化时被侵染，形成类似马勃状的组织块，初期白色，后变黄褐色，表面渗出水珠并腐烂；当长成小菇蕾时被侵染，表现为畸形，菇柄膨大，菇盖变小，菇体部分表面附有白色绒毛状菌丝，后变褐，产生褐色液滴；当出菇后期被侵染，不仅形成畸形菇，菇体表面还会出现白色绒状菌丝，后期变为褐色病斑。
褐腐病菌主要侵染蘑菇，但香菇、草菇、平菇、灵芝、银耳等食用菌也偶有发现。
防治方法如下：
（1）菇房消毒：及时清除菇房废料，并彻底消毒处理，不要等待进新料时再清理前季废料。有条件的菇房可通蒸气消毒，70～75℃持续4小时，而后通风干燥。床架材料宜用钢材和塑料等无机材料制成，经冲洗和消毒后，孢子不易生存。
（2）覆土消毒：首先要选取未含有食用菌废料的土壤，应选取稻田中20厘米以下的中层土或河泥土，经太阳暴晒后使用。在发病区土壤中宜用杀菌剂处理，如用菇丰配成2 000倍液喷雾，边喷边翻土，而后建堆盖膜闷5天后再使用。推广河泥砻糠覆盖技术，可有效地降低土壤带菌的几率。
（3）培养料病菌处理：在发病区，培养料宜用杀菌剂拌料，如2 000倍液的菇丰。当菇床出现症状时要及时挖除，撒上杀菌剂，让其干燥，病区内不要浇水，防止孢子、菌丝随水流传播。
