苗期染该病后，幼叶呈紫铜色卷曲，叶片上有许多黑斑，叶片背面脉紫色失绿，茎秆产生退色条斑，病株生长缓慢或矮化、落叶、萎蔫、萎缩，产量下降，严重时植株直接萎蔫枯死，此症状很容易和条斑病毒混淆。番茄在结果期染病，果实表面出现退绿凸起环斑，轮纹不明显，或呈瘤状突起的褐色坏死斑，可造成病果脱落。如果果实成熟时染病，病斑轮纹明显，退绿斑点在有色期最明显，较严重时果实呈僵缩，病斑变褐坏死，脐部症状很容易和脐腐病相混淆，应注意识别。
对番茄斑萎病毒病，若不能对症下药，就很难得到有效防治。因此，很多菜农对番茄斑萎病毒病头疼不已，番茄斑萎病毒病是通过植物寄主间自然传播，主要是通过刺吸或害虫，如蚜虫、飞虱、蓟马传播，同时，高温、干旱也利于发病。田间管理差，农事操作中病健株相互摩擦，也可引起发病。目前还没有对该病毒直接有效的防治措施，只能通过防治刺吸式害虫、加强农事等措施进行防控。在棚室防治用15%异丙威熏蒸杀虫，每亩用250克，同时铲除杂草；棚室内可悬挂黄色粘虫板防控，培育壮苗，拔除病株；番茄定植后，发现刺吸式害虫，及时用10%吡虫啉可湿性粉剂1500倍液防治，也可用25%阿克泰水分散粒剂1500倍液喷雾防治，喷药时最好喷到茎基部，以杀灭根部幼虫和蛹。用20%吗啉胍?铜300倍液防治，或用香菇多糖300倍液防治，对番茄花叶病毒病、斑萎病毒病均有一定效果。
