一、药物的剂量、剂型
药物的作用随剂量的大小而有差异，甚至发生质的变化，如金属性收敛药硫酸锌用于局部时，低浓度具有收敛作用，中等浓度有刺激作用，而在高浓度时却具有腐蚀作用。药物的剂型不同，即使在其药物剂量相同的情况下，其作用强度、作用效果和作用的时间也不相同。
二、给药方式
给药途径、给药时间以及用药次数和反复用药均能影响药物作用效果。药物药浴（或遍洒）等外用的给药途径与口服（或注射）等给药途径在药物的作用上有明显的差别；不同的给药时间（白天或夜间），即使药物的使用剂量相同，效果也会有所不同。
三、动物状态
水生动物自身的情况和生理状态会产生不同的药效作用。
1.种属差异：不同种、系水产动物或同种系不同个体间对药物的敏感性存在差异。
2.生理差异：一般幼龄、老龄水产动物对药物比较敏感。
3.个体差异：不同的个体对药物的耐受性是不同的，这也许与个体的遗传因素有关。
4.机体的机能与病理状况：一般瘦弱、营养不良和处于病理状况下的水生动物对药物比较敏感。
四、环境因素
对于水生动物来说环境对药物作用的影响较大，主要影响因素：
1.水温：药物一般与水温正相关，但有的药物却相反。
2.有机物：它会影响大多数药物的药效，如高锰酸钾、含氯消毒剂。
3.酸碱度：酸性药物、阴离子表面活性剂以及四环素类等抗菌药物，在碱性水体中作用减弱；而碱性药物、磺胺类药物及阳离子表面活性剂等，随pH值升高药效增强。
4.溶氧：溶氧较高时水生动物对药物的耐受性增强；溶氧较低时，则水生动物容易发生中毒现象。
5.光照和季节：水生动物在夜间比在白天对药物的耐受能力强，在夏季比在冬季对药物敏感。
6.病原体的状态和抵抗力：有些能形成孢囊的寄生虫，在药物的刺激下往往能形成孢囊，它们对药物的抵抗力就明显加强。
此外，捕捞、运输、换水等应激因素，也能增加水生动物对药物的敏感性。
