当前的农药防治方法是消灭土壤中的致病菌，但是对大面积土壤彻底消毒非常困难。另外在土壤消毒过程，也把土壤中对有害生物起抑制作用的有益生物一起杀死，不仅不能有效控制致病菌的生长，反而会起到相反的作用。因此在采取农药防治措施的同时，建议合理调节土壤性质培育肥沃土壤，防止黄叶病的发生或降低发病率。
1、调节土壤营养状况。根据香蕉吸收氮、磷、钾的比例（为1：0.2：2.5－3），应避免偏施氮肥，而多施钾肥，培育健康的蕉苗，增强香蕉的抗病性。
2、增施有机肥。香蕉移栽前和大头（可见球茎时）期，每株香蕉最好施用2－4斤完全腐熟的有机肥（能多施的要多施），如圈粪或堆沤肥。完全腐熟的有机肥不仅能供应适量的养分，而且可以改善土壤的结构，调节土壤保水、保肥性，还能丰富土壤中的有益生物，改善土壤微生态系统，从而抑制或控制黄叶病菌生长。在有条件的地方向有机肥中添加有益菌，则效果更好。
3、调节土壤酸碱度。香蕉移栽前用石灰或石灰氮（商品名叫正肥丹）处理土壤，通过中和土壤酸性，破坏香蕉枯萎病的发病条件而控制黄叶病的发生。另外石灰或石灰氮中的钙还可以改善香蕉的钙素营养，增强香蕉的抗病性。在香蕉生长过程选用化肥时，宜选用能降低土壤酸度的肥料，如氮肥最好选硝态氮肥等。
4、淹水闭气处理土壤。引起香蕉枯萎病的生物为一种好气生物，因此在病害严重的地块，进行一定时期的淹水处理可达到灭菌的效果，从而控制香蕉枯萎病的发生。
5、生病的香蕉植株要挖掉。砍下的香蕉植株切记不可扔进排水沟、河流等水系，以免病菌浸染水系，从而造成更多的病害。砍下的香蕉业不可以随手丢在香蕉园里，以免病害的扩撒。砍下的香蕉要集中放在与蕉园、水系隔离的地方，晾晒干后焚烧。或将砍下的香蕉埋入与香蕉园隔离的地方，在埋染病的香蕉时，最好撒石灰或石灰氮消毒。地里香蕉头的地方要用石灰等药物消毒。
总之，在化学防治的基础上再结合土壤培肥和土壤环境的调节措施，必定会大大降低甚至消除香蕉枯萎病的危害。
