1.农业防治。因地制宜，选用抗病虫能力强的优良品种，如巴西、威廉斯。加强肥水管理，促进植株健壮成长，提高其抗病能力。实行与香蕉亲缘关系较远的作物如果蔗、花生等轮作，以减少病源虫源，减轻病虫害。但不得与蔬菜、瓜类轮作。控制杂草生长，及时割除植株上枯叶及受病虫危害严重的叶片，清理出蕉园进行深埋或烧毁。发现花叶心腐病或束顶病的病株及时清除，在清除之前先用阿克泰、敌敌畏等杀虫剂喷杀蚜虫后处理。
2.生物防治。优先使用微生物源、植物源生物农药，如苏云金杆菌粉剂、阿维虫清等杀虫药剂，有利保护捕食螨、食螨蝇和食瓢虫等天敌，以及人工释放捕食螨等天敌。
3.物理机械防治。使用诱虫灯诱杀夜间活动的昆虫。利用黄色板、蓝色板和白色板等诱杀害虫。采用果实套袋技术，在香蕉断蕾后，幼果伸直时套袋，套袋前对果穗统一喷施一次爱苗、世高加阿克泰、吡虫啉等杀虫杀菌剂防治花蓟马和黑星病。
4.化学防治。不得使用未经国家有关部门登记和许可生产的农药，不得使用剧毒、高毒、高残留或具有“三致”（致癌、致畸、致突变）的农药，按照无公害食品安全卫生标准中有关的农药使用准则和规定，严格掌握施用剂量、每季使用次数、施药方法和安全间隔期。对标准中未规定的农药严格按照农药说明中规定和使用浓度范围和倍数，不得随意加大剂量和浓度。对限制使用的中等毒性农药应针对不同病虫害使用其浓度范围中的下限。无公害香蕉农药使用药剂有：治虫有多虫清、苏云金杆菌、吡虫啉、除虫菊等杀虫剂；防病有爱苗、敌力脱、灭病威、施保克、代森锰锌、波尔多液等杀菌剂；促进生长有丰满剂等。限用中等毒性有机农药乐果、敌敌畏、杀虫双、氯氰菊酯、敌杀死、速螨酮等。对限制使用的农药最后一次用药距采收间隔期应30天以上，对允许使用的农药最后一次用药距采收间隔应有25天以上。
