1、在同等亩穴数情况下，两优培九较汕优63少3.5-5万穗，平均每穴少2个以上，因而产量低了80千克左右，减产达到15%，这类田块产生的原因是：⑴两优培九前期生长势较弱，分蘖期偏迟且分蘖强度差；⑵用肥管水不当；⑶农户不熟悉其特性，只会套用汕优63组合的栽培方法，针对发生的情况不能采取相应的措施。即使中后期生长旺盛苗数多，但多为无效分蘖。由于早期的一次分蘖少，因而有效大穗不足。
2、抽穗不整齐，籽粒充实度差异大，影响了两优培九的产量和质量，其表现：⑴抽穗不整齐，整田抽穗扬花期要比汕优63长3-5天，个别田块甚至1星期；⑵大、小穗间差异大（大穗超250粒而小穗不足80粒）；⑶籽粒充实度差异大，同一穗中早的籽粒已饱满并转色，迟的才刚开花。收获期对实粒情况分析：第100粒实粒中籽粒仍呈绿色的近18%；颜色虽变黄但籽粒尚不饱满的约占21%；真正籽满粒饱的成熟籽粒只占实粒数的61%左右，影响了总体千粒重，不但对产量构成不利，同时增加了稻米加工难度，质量难以达到应有的优质标准。
3、稻曲病危害严重，是影响产量和质量的又一因素。苗前期直至抽穗期，两优培九长相清秀，田间基本无病害。但灌浆后却普遍发生稻曲病，尤其是防治不当的田块或阴雨天过多的年份，更是病情严重。
二、防止对策
1、培育带蘖壮秧，适时早栽。⑴严格控制播种量：秧田亩播种量一定要在15千克以内，最好控制在13-14千克；⑵增加秧田肥力，争取多施用有机肥，提高有机质含量；⑶控制秧龄，适时早栽；⑷大田基肥要足，追肥要早；⑸栽插要浅，不能栽深；⑹大田要浅水勤灌，切忌深水，以利早发。有抛秧基础的农户，最好采取抛秧方式，及时管理使苗进大田即分蘖，更多地获得早期一次性分蘖，争取有效大穗。
2、烤田控蘖，争取穗肥。在打好苗架基础上，当基本苗数够20万时，即可烤田。一般要求烤田程度略重于汕优63（最好分次烤田），烤到叶色转淡，叶尖刺手掌，控制住了无效分蘖再复水。只有这样才能保障大穗的形成和抽穗的整齐，不至于抽穗扬花期过长，从而增加实粒数，提高籽满粒饱色黄的粒数比例，达到既优质又高产目的。抽穗扬花、灌浆转色阶段，一定要保证田间不缺水。收获前5天左右，放干水以便收获。为保证有足够的肥力，满足籽粒灌浆的需要，视苗情因地制宜补施穗肥，肥种不要单一，最好每亩用三元复合肥（3×15%）10-15千克在见穗前施入。必要时，在抽穗后喷施磷酸二氢钾1-2次。
3、有效防治稻曲病发生。防治稻曲病要做到"提前"防御，决不能"见病治病"。生产中无论天气怎样，田间如何清秀，都必须在抽穗期，用多菌灵或粉锈宁或井岗霉素等有效农药防治1次。而地势低洼、泥深、肥力过重、叶色深的田块或遇到阴雨天过多时，更应在始穗期和齐穗期做到喷药2遍，以保证防治效果。
