水肥管理。在浇定植水的基础上，定植后第三天浇缓苗水。随后及时中耕松土，培土封沟，辣椒定植时在沟内，培土后把原来的沟变成垄，原来的垄变成了沟，但培土不可过高，以13厘米为宜。培土封沟后适当蹲苗，促使根系向纵深发展，达到根深叶茂。此时如水肥过多，容易引起植株徒长，坐果率降低。辣椒对湿度要求不高，若空气湿度经常高于50%—60%，容易引起植株徒长，导致落花落果，门椒坐不住。当第一层果实达到2—3厘米大小时，植株茎叶和花果同时生长，要及时浇水和追肥，每亩施腐熟人粪尿500—1000公斤或尿素10公斤或真根5—10公斤稀释200—500倍与化肥交替浇施，施肥后应及时中耕，可改善土壤的通透性，并提高土壤的保肥能力。
进入盛果期，植株生长高大，发身和结果同时进行。为防止植株早衰，要及时采收下层果实（门椒和对椒）并要加强浇水，亩用真根5—10公斤稀释200—500倍与尿素等化肥交替使用，保持土壤湿润，以利植株继续生长和开花坐果。
结果后期气温凉爽，日照充足，适合辣椒的生长发育，是辣椒开花结果的高峰时期，所以要加强水肥管理，促进辣椒多结果，增加产量。追肥可与浇水交替进行，浇一次清水后，再结合浇水追肥一次，每亩用氮磷钾各15%的复合肥或磷酸二氢钾10公斤或真根5—10公斤，每隔7—8天浇水一次。9月下旬因天气转凉，也可追施稀粪水，往后浇水间隔时间应适当延长。
化学调控。当辣椒初花期生长过旺徒长时，可用多效唑、矮壮素或缩节胺等植物生长调节剂进行化控，为提高秋延后大棚辣椒的坐果率，也可用生长素（2.4—D或防落素）处理，保花保果效果较好，2.4—D浓度为15—20ppm(百万分之15—20)，上午10时以前抹花效果比较好。
整枝。大棚中生长的辣椒，生长旺盛，株型高大，枝条易折，为作业方便和便于通风透光，可用塑料绳吊枝或在畦垄外侧用竹竿水平固定植株，防止植株倒伏。对过于细弱的侧枝以及植株下部的老叶及无果侧枝可以疏剪，以节省养分，有利通风透光。
