洪水淹没水稻因地区不同有早有迟，被淹时间有长有短，加之各地水稻生育进程不同，因而各地水稻受损程度也不同。
如果进入孕穗期、抽穗期和乳熟期的杂交中稻分别淹水1天、2天和3天，会发现杂交中稻对洪水较敏感的时期是孕穗期和抽穗期，因洪水淹没的产量损失也最大，两天以上损失率可高达90%以上，水稻几乎绝收;其次是乳熟期，相对于孕穗期和抽穗期，产量损失较小，淹没两天以上产量损失在40%～60%。但无论上述哪个时期，总体上都是被淹没的时间越长，产量损失越重。洪水淹没杂交中稻后导致减产的主要原因是结实率极低，其次是死穗造成有效穗下降，最后是千粒重下降(乳熟期受淹)。
采取不同措施
由于洪灾发生时各地杂交水稻生育进程不同，洪水退去后采取的补救措施也不尽相同。
洪水退去后，各地要在了解农户情况的同时抓紧稻田现场查看。假如，孕穗期和抽穗期淹水时间长 (一般在两天左右)的田块，太阳晒后稻穗已干枯(抽穗期)，绝收已成定局，这类田块要应及时割去稻株上部蓄留再生稻。如这两个时期淹水时间较短(一天以内)，可保留杂交中稻，仍有一定收成;但要对水稻叶片进行冲洗，保住叶片的光合作用能力，同时加强对水稻纹枯病、稻瘟病、飞虱和稻纵卷的防治。
蓄留技术要点
水稻孕穗期和抽穗期受洪水淹没时，由于茎鞘积累的营养物质还未向穗部转移，此期茎鞘营养物质仍较为富。同时，这两个时期茎秆节上休眠芽一般在5毫米以内，还没伸长，受洪水影响较小。虽然洪水退去后，由于水稻叶片有淤泥，太阳晒后出现萎蔫或干枯(抽穗表现最为明显)，但水稻茎秆和休眠芽仍然成活，因此可蓄留再生稻。
低留稻桩。再生芽来自水稻不同节位的休眠芽，其生育期和穗子大小因节位不同而不同;一般上部节位休眠形成的稻穗生育期短、穗子小，产量不高。下部节位休眠芽形成的稻穗生育期较长、穗子较大，产量较高。
目前受洪水淹没的杂交中稻，一般在孕穗期至齐穗期，割去上部蓄留再生稻，时间上较正常杂交中稻收割后蓄留再生稻早近1个月，不存在后期低温影响结实的问题。从挽回更多损失和再生稻高产角度出发，割去稻株上部，保留稻桩20厘米(5-6寸)最佳，有利于再生稻大穗多穗高产。如果不割地上部分，一是稻田群体大、湿度大，纹枯病易发生;二是休眠芽中上部发生较多，萌发后生长在头季稻的荫蔽之下，稻穗较小，不易形成高产;三是再生稻生育进程不一致，成熟期也不一致，造成产量不高，多次收割，且收割不便。
适当追肥。现在蓄留再生稻的田块，一般被洪水淹没时间较长，对水稻根系活力有一定影响。为此，在杂交中稻上部割去后，要及时追施一次肥;以速效肥为佳，每亩可施尿素5公斤，以护根促芽，为再生稻高产奠定基础。
防病治虫。针对今年迁飞性水稻虫害基础量大且早，加之是洪水淹没过的田块，在杂交中稻上部割去后，应在当地植保部门和技术人员指导下，加强水稻纹枯病、稻瘟病、飞虱和稻纵卷等病虫害的防治，为再生稻高产创造条件。
