入窖前准备：入窖前对薯块要严格挑选，有病斑的，虫咬的、收运过程碰伤的薯块都不能入窖。经过严格挑选的薯块，用50%的多菌灵可湿性粉剂或40%多菌灵胶悬剂500倍液，将配好药液倒入大缸或大锅中，再把薯块装到筐里浸入药液中，上下提动使薯块都均匀浸药后提出，淋去多余药液即可入窖，防效可达95%以上。
前期管理：在薯块入窖20天左右，由于薯块呼吸旺盛，淀粉向糖转化显著，窖内温度升高，水分也多，病菌发展较快，特别是黑斑病。这一时期应以通风散热为主，要敞开窖口和通气孔，把窖温控制在15℃以下。
中期管理：进入寒冬季节，红薯生理活性减弱，呼吸趋缓，窖内温度和湿度变化速度减慢。随着气温的下降，窖内温度也相应下降。这时应及时封窖保温，使窖温保持在10－14℃的安全范围内。若温度继续下降 10℃ 时，要用麦草，稻草覆盖薯堆，做好保温防冻。
后期管理：立春之后，随着气温的逐渐回升，地瓜的生理活性开始增强，此期应适当敞窖通风，降温排湿，以防发芽或腐烂。
