1、减少有效水体体积过多的淤泥使池水变浅，鱼类的生存空间变小，直接影响池塘的单位面积产量。
2、容易造成鱼类缺氧淤泥中含有大量的有机物，这些有机物氧化分解会消耗掉水体中的大量氧气，使水体处于低氧或缺氧状态，不利于鱼类的生长，并且长期处于低氧的环境下会使鱼类的饵料系数增大。
3、产生有毒有害物质淤泥中的有机物经嫌气性细菌分解会产生大量的氨、硫化氢、甲烷等物质，这些物质对鱼类都有一定的毒害作用。
4、容易引起水质酸化淤泥中的有机物在嫌气和厌气微生物的作用下会产生各种有机酸和无机酸，使水质酸化，PH值明显下降。
5、导致病害发生淤泥是各种细菌、病毒、寄生虫的生存和繁殖的最佳场所，这些都极易使鱼类发生疾病，而且治疗后还特别容易反复。
6、影响水产品的质量淤泥中的部分有机物在一定条件下经分解发酵后会产生一些有机酚的物质，这是使鱼在吃起来时会感觉有一点柴油气味的原因，这严重影响了水产品的质量和经济效益。
诸上几个方面可见淤泥太厚对养殖生产的危害是非常大的，因此建议广大养殖户好好利用冬季池塘中水产品全部出售之后的空闲季节对池塘进行一番清整可有效改善这些状况。具体清整做法如下：
1、清除池塘中过多的淤泥，使淤泥的厚度保持在15厘米左右，并加高加固池埂；将清出的淤泥放在旱田里用作来年长陆生植物以充当有机肥料的作用。
2、每亩水面用75公斤的生石灰化水全池泼洒，同时让底泥充分曝露在阳光下进行冻晒以起到杀灭野杂鱼和部分病原微生物的作用。
3、疏峻河道，利用这一段冬季的枯水期将进排水系统进行清整，以确保来年的养殖进排水系统畅通。
池塘清整后的好处：
1、加高加固池埂后可增强池塘的保水性能，还有利于来年养殖时汛期的防洪涝工作。
2、增加池塘的有效体积有利于增加池塘的单位面积产量。
3、减少池塘中大量的有机物减少了大量的耗氧因子，有效保证鱼类的耗氧需求，降低鱼类的饵料系数。
4、减少大量有毒有害物质的来源淤泥少后可减少氨、硫化氢、甲烷等物质的来源。
5、生石灰清塘后可有效改良水质，提高池水的缓冲能力，保持PH值稳定，使池水呈弱碱性，另外还有利于促进土壤中的氮、磷、钾等营养盐类的释放，增加水体的肥度。
6、减少各种病原菌繁衍生息的场所可有效降低鱼类的发病率，减少药物的使用成本。
7、提高水产品的质量，在优质水环境中生长出来的水产品的品质明显高于淤泥过厚的池塘中养出来的水产品，其市场价格也明显要高，因此其经济效益也会明显提高。
